21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0534 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0518  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00386724  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0515  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00290527  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0534  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.323371  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0577  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.176704  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0524  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0299782  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3149  conserved hypothetical protein  95.16 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.353237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00417  hypothetical protein  95.16 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0551  hypothetical protein  95.16 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.745487  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0504  hypothetical protein  95.16 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3155  hypothetical protein  95.16 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0495  hypothetical protein  95.16 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0537  hypothetical protein  95.16 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00412  hypothetical protein  95.16 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0941  hypothetical protein  93.55 
 
 
124 aa  248  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1119  hypothetical protein  68.47 
 
 
122 aa  167  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0656157  unclonable  0.00000000942965 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3213  hypothetical protein  63.96 
 
 
122 aa  161  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0128775  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3072  hypothetical protein  63.96 
 
 
122 aa  161  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241961  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3051  hypothetical protein  63.06 
 
 
122 aa  157  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1066  hypothetical protein  58.33 
 
 
122 aa  154  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.814667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3245  hypothetical protein  58.33 
 
 
122 aa  154  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1009  hypothetical protein  60.36 
 
 
122 aa  150  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>