9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3193 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3208  GcvB RNA  100 
 
 		 147 bp  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00208487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3193  GcvB RNA  100 
 
 		 147 bp  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0302134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3145  GcvB RNA  100 
 
 		 147 bp  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3128  GcvB RNA  100 
 
 		 147 bp  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000113234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3308  GcvB RNA  100 
 
 		 147 bp  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000406754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0022    94.56 
 
 		 147 bp  228  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4976  GcvB RNA  94.56 
 
 		 147 bp  228  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4073  GcvB RNA  94.56 
 
 		 147 bp  228  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000152516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4768  gcvB RNA  97.32 
 
 		 113 bp  198  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000442516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>