More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3065 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3065  invasion protein regulator  100 
 
 		 553 aa  1144    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.359189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2998  invasion protein regulator  100 
 
 		 553 aa  1144    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000362876  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3081  invasion protein regulator  100 
 
 		 553 aa  1144    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3029  invasion protein regulator  99.82 
 
 		 553 aa  1144    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0229765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3186  invasion protein regulator  99.64 
 
 		 555 aa  1108    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.735415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4023  invasion protein regulator  36.76 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0836  transcriptional regulator, CadC  29.28 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3000  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000507386  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0862  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3173  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4123  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  24.23 
 
 		 522 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  23.31 
 
 		 531 aa  90.5  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  24.59 
 
 		 521 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  27.18 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  22.49 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  23.84 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  22.68 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  20.94 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3304  transcriptional regulatory protein-like protein  37.5 
 
 		 580 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  23.83 
 
 		 479 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.42 
 
 		 737 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  23.83 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  36.11 
 
 		 977 aa  72.4  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  32.32 
 
 		 521 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 		 821 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  39.18 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  22.38 
 
 		 527 aa  70.1  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  37.38 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 236 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  39.36 
 
 		 236 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  36.52 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  36.52 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  36.52 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  23.9 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2661  two component transcriptional regulator  32.65 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.36546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.38 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5304  transcriptional regulator, CadC  35.9 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  35.38 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 959 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1241  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  40 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0151467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  32.5 
 
 		 711 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3769  transcriptional regulator, CadC  36.17 
 
 		 756 aa  61.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0208668  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 1080 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.54 
 
 		 798 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  21.33 
 
 		 619 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  20.92 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  24.66 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 240 aa  60.1  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4485  transcriptional regulator, CadC  34.74 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0418  two-component system response regulator  27.37 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.815166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  37.78 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001593  putative two-component response regulator  33.7 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000660606  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0437  transcriptional regulatory protein-like protein  35.57 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000809247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 972 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0563  transcriptional regulatory protein-like protein  31.63 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  31.06 
 
 		 906 aa  57  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.86 
 
 		 224 aa  57  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0195  transcriptional regulator, CadC  35.48 
 
 		 277 aa  57  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0335  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 222 aa  57  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000018466  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  39.51 
 
 		 232 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 239 aa  56.6  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4637  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 222 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  35.48 
 
 		 234 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 928 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  39.77 
 
 		 950 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  35.06 
 
 		 229 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 224 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 1020 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 231 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  27.59 
 
 		 774 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0794  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 		 724 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 		 945 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 		 228 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  39.24 
 
 		 230 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 956 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03140  two component response regulator transcription regulator protein  30.69 
 
 		 245 aa  54.7  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2656  DNA-binding transcriptional activator CadC  30.53 
 
 		 541 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0798  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 220 aa  54.7  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4261  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 295 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6788  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 230 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241896 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0821  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 220 aa  54.7  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.321247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  35.23 
 
 		 1010 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5235  DNA-binding response regulator  32.61 
 
 		 220 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0048741  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  36.71 
 
 		 252 aa  54.3  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 652 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 1075 aa  54.7  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 493 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.21 
 
 		 232 aa  54.7  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0244  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 233 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  32.32 
 
 		 1092 aa  54.7  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.44 
 
 		 265 aa  54.7  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 233 aa  54.7  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  36.14 
 
 		 234 aa  54.7  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 227 aa  54.7  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 493 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  32.65 
 
 		 1075 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 493 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>