76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2141 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2086  transcriptional activator FlhD  100 
 
 
113 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000128662  unclonable  1.32042e-30 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2141  transcriptional activator FlhD  100 
 
 
113 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000294408  hitchhiker  1.8448199999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2081  transcriptional activator FlhD  100 
 
 
113 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000102122  decreased coverage  0.000000325963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1319  transcriptional activator FlhD  100 
 
 
116 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102407  hitchhiker  1.2450300000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1196  transcriptional activator FlhD  100 
 
 
116 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000242904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1748  flagellar transcriptional activator  89.66 
 
 
116 aa  208  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00200339  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1988  transcriptional activator FlhD  89.66 
 
 
116 aa  208  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.83852e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2125  transcriptional activator FlhD  89.66 
 
 
116 aa  208  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000669135  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1740  transcriptional activator FlhD  89.66 
 
 
116 aa  208  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.140551  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1292  transcriptional activator FlhD  89.66 
 
 
116 aa  208  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000962983  hitchhiker  0.0000000541956 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01852  hypothetical protein  89.66 
 
 
116 aa  208  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01863  transcriptional activator FlhD  89.66 
 
 
119 aa  207  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0964972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2631  transcriptional activator FlhD  89.66 
 
 
116 aa  207  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000042575  decreased coverage  0.00000000000000177734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2470  transcriptional activator FlhD  86.21 
 
 
119 aa  203  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000162206  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1536  transcriptional activator FlhD  77.59 
 
 
116 aa  177  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00409913  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2989  transcriptional activator FlhD  77.59 
 
 
116 aa  177  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1508  transcriptional activator FlhD  77.59 
 
 
116 aa  176  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00168962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2615  transcriptional activator FlhD  85.11 
 
 
116 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00174492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1851  transcriptional activator FlhD  84.04 
 
 
116 aa  161  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00649887  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1634  transcriptional activator FlhD  75.86 
 
 
116 aa  159  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1745  transcriptional activator FlhD  75.86 
 
 
116 aa  159  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0465343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0160  transcriptional activator FlhD  50 
 
 
106 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3685  transcriptional activator FlhD  49.48 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0479356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0251  transcriptional activator FlhD  51.58 
 
 
106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.272969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0082  transcriptional activator FlhD  51.58 
 
 
222 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3353  transcriptional activator FlhD  51.58 
 
 
106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719466  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0233  transcriptional activator FlhD  51.58 
 
 
106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0164  transcriptional activator FlhD  48.04 
 
 
106 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0177  transcriptional activator FlhD  48.04 
 
 
106 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5604  transcriptional activator FlhD  48.45 
 
 
105 aa  106  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2864  transcriptional activator FlhD  51.58 
 
 
106 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3111  transcriptional activator FlhD  51.58 
 
 
106 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3941  transcriptional activator FlhD  51.58 
 
 
106 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.922681  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3860  transcriptional activator FlhD  51.58 
 
 
106 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1679  transcriptional activator FlhD  51.58 
 
 
106 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.614234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3440  transcriptional activator FlhD  51.58 
 
 
222 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3187  transcriptional activator FlhD  51.58 
 
 
106 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0821946  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2856  transcriptional activator FlhD  48.04 
 
 
106 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2979  transcriptional activator FlhD  44.55 
 
 
106 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000641215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1690  flagellar transcriptional activator  51.04 
 
 
105 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3820  transcriptional activator FlhD  45.36 
 
 
106 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173639  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0114  transcriptional activator FlhD  43.14 
 
 
106 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241095  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4160  flagellar transcriptional activator  44.9 
 
 
118 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4639  transcriptional activator FlhD  48.42 
 
 
106 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187238  normal  0.541789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0858  transcriptional activator FlhD  46.32 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0428294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4544  transcriptional activator FlhD  46.32 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114093  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1413  transcriptional activator FlhD  41.9 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4155  transcriptional activator FlhD  41.35 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4043  transcriptional activator FlhD  41.35 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2028  putative flagellar transcriptional activator transcription regulator protein  42.86 
 
 
109 aa  92  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00113086  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7083  transcriptional activator FlhD  48.15 
 
 
106 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2371  flagellar transcriptional activator  42.86 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.290285  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2884  flagellar transcriptional activator, FlhD subunit  41.9 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0514337  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2006  flagellar transcriptional activator, FlhD subunit  41.9 
 
 
109 aa  83.6  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0823929  hitchhiker  0.00228476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1305  transcriptional activator FlhD  39.42 
 
 
105 aa  83.6  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4211  transcriptional activator FlhD  39.81 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24300  flagellar transcriptional activator  37.5 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.757302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1943  transcriptional activator FlhD  40.95 
 
 
105 aa  82  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1240  transcriptional activator FlhD  40.38 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2869  transcriptional regulator  41.18 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2236  flagellar transcriptional activator  42.31 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489857  normal  0.0382615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1005  flagellar transcriptional activator  40.2 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1860  flagellar transcriptional activator, FlhD subunit  41.67 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.309366  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0151  flagellar transcriptional activator  40.2 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3700  flagellar transcriptional activator FlhD  37.5 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7665  transcriptional activator FlhD  40.91 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274681  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3229  flagellar transcriptional activator  33.73 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5178  flagellar transcriptional activator  34.83 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1513  flagellar transcriptional activator  38.89 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5921  putative flagellar transcriptional activator FlhD  38.81 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.866617  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6190  putative flagellar transcriptional activator FlhD  38.81 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188965  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7384  hypothetical protein  32.84 
 
 
77 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3260  regulator of flagellar biosynthesis FlhD  34.78 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3208  FlhD family protein  34.78 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3246  FlhD family protein  34.78 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1364  flagellar transcriptional activator FlhD  37.5 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>