27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1905 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1613  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  173  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000462089 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1431  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  173  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.438195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1847  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  173  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.0477521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1905  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  173  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000118284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1842  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  173  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.787901  hitchhiker  0.0000000343425 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2376  conserved hypothetical protein  92.77 
 
 
83 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000109901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01259  hypothetical protein  92.77 
 
 
83 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1905  hypothetical protein  92.77 
 
 
83 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000803674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1497  hypothetical protein  92.77 
 
 
83 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1858  hypothetical protein  92.77 
 
 
83 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  6.4043e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2355  hypothetical protein  92.77 
 
 
83 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0577958  hitchhiker  0.000000292955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1472  hypothetical protein  92.77 
 
 
83 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0959551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1382  hypothetical protein  92.77 
 
 
83 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01249  hypothetical protein  92.77 
 
 
83 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.356816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2197  hypothetical protein  83.13 
 
 
99 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000275948 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2014  hypothetical protein  65.06 
 
 
89 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0527787  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2035  hypothetical protein  67.47 
 
 
83 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186112  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2305  hypothetical protein  67.47 
 
 
83 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2658  hypothetical protein  66.27 
 
 
83 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00672751  unclonable  0.0000000202391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1924  hypothetical protein  66.27 
 
 
83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0220356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2163  hypothetical protein  65.06 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00982046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2315  hypothetical protein  66.67 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.140451  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1925  hypothetical protein  66.23 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003950  protein YciN  58.67 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000828356  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1162  hypothetical protein  56.76 
 
 
81 aa  91.3  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.129271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01573  hypothetical protein  58.11 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1333  hypothetical protein  57.89 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000467311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>