8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1302 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1287  SraB RNA  100 
 
 
168 bp  333  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00278815  hitchhiker  0.00000000000210645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1302  SraB RNA  100 
 
 
168 bp  333  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00000000242026 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1258  SraB RNA  100 
 
 
168 bp  333  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000153878  normal  0.271631 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1998  SraB RNA  100 
 
 
168 bp  333  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000741175  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2181  SraB RNA  100 
 
 
168 bp  333  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000964894  hitchhiker  0.0000000000036206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4740  sraB RNA  94.44 
 
 
169 bp  111  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.7065600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2731  SraB RNA  94.44 
 
 
169 bp  111  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.80375e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1466  SraB RNA  94.44 
 
 
169 bp  111  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000106954  hitchhiker  0.000000000014141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>