More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0385 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2920  replicative DNA helicase  90.39 
 
 
458 aa  853    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0425045  hitchhiker  0.00000000000000950507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0385  replicative DNA helicase  100 
 
 
458 aa  931    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.139833  hitchhiker  0.000000000000128218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0625  replicative DNA helicase  98.47 
 
 
458 aa  918    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.849454  hitchhiker  0.00500749 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2244  replicative DNA helicase  48.47 
 
 
457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1140  replicative DNA helicase  46.62 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0320772  hitchhiker  6.75353e-23 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2248  DnaB family helicase  45.95 
 
 
463 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000601799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  35.81 
 
 
468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  36.34 
 
 
467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  35.81 
 
 
468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  35.81 
 
 
451 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  36.94 
 
 
476 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  34.64 
 
 
464 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  33.64 
 
 
464 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  34.64 
 
 
464 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  35.65 
 
 
471 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  35.65 
 
 
471 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  35.65 
 
 
471 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  35.65 
 
 
471 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  35.65 
 
 
471 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  38.9 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  39.18 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  36.08 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  34.53 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  34.53 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  34.3 
 
 
471 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  38.63 
 
 
468 aa  221  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  34.3 
 
 
471 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  34.3 
 
 
471 aa  221  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  34.3 
 
 
471 aa  221  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  34.3 
 
 
471 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  34.3 
 
 
471 aa  221  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  34.3 
 
 
471 aa  221  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  35.63 
 
 
461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  35.44 
 
 
478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  34.3 
 
 
471 aa  220  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  35.89 
 
 
471 aa  220  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  35.89 
 
 
471 aa  220  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  36.02 
 
 
468 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  36.02 
 
 
468 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  35.79 
 
 
468 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  36.04 
 
 
468 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  36.02 
 
 
468 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  36.02 
 
 
468 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  38.36 
 
 
474 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  35.59 
 
 
468 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  35.45 
 
 
466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  34.1 
 
 
462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  34.31 
 
 
460 aa  217  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4444  replicative DNA helicase  33.96 
 
 
447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  33.18 
 
 
464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  34.31 
 
 
460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1060  primary replicative DNA helicase  36.28 
 
 
488 aa  216  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  31.65 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  35.65 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  32.73 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  31.65 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  32.34 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  35.81 
 
 
468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  33.41 
 
 
463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0302  replicative DNA helicase  34.92 
 
 
451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  32.34 
 
 
465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  35.6 
 
 
472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  38.08 
 
 
468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58990  putative DNA helicase  33.49 
 
 
448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144919  normal  0.0290117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  31.42 
 
 
465 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3371  DnaB family helicase  35.99 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0357  replicative DNA helicase  35.09 
 
 
465 aa  213  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.973101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  34.68 
 
 
468 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  34.68 
 
 
468 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  34.68 
 
 
468 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  34.68 
 
 
468 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1347  replicative DNA helicase  33.71 
 
 
458 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00018  replicative DNA helicase  35.21 
 
 
466 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1720  replicative DNA helicase  33.71 
 
 
458 aa  211  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  35.24 
 
 
473 aa  210  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  35.36 
 
 
468 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  34.74 
 
 
461 aa  210  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4115  replicative DNA helicase  34.63 
 
 
451 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  35.47 
 
 
437 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  34.92 
 
 
465 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  33.63 
 
 
466 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  34.85 
 
 
468 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  36.49 
 
 
468 aa  208  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  36.99 
 
 
468 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  33.93 
 
 
465 aa  207  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0550  replicative DNA helicase  37.16 
 
 
470 aa  206  1e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  36.21 
 
 
472 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1232  replicative DNA helicase  35.5 
 
 
452 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.323473  normal  0.298764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  32.8 
 
 
446 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0905  replicative DNA helicase  33.11 
 
 
479 aa  203  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163785  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  33.33 
 
 
458 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  36.26 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  34.28 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  36.26 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  32.35 
 
 
447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0931  replicative DNA helicase  37.57 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000071326 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  31.55 
 
 
443 aa  200  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1531  DnaB helicase  32.87 
 
 
448 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498152  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2278  replicative DNA helicase  35.09 
 
 
455 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467849  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  36.19 
 
 
442 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>