19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0037 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0037  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0014  hypothetical protein  83.73 
 
 
253 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.415315  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1505  hypothetical protein  70.25 
 
 
251 aa  361  5.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.619841 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0038  putative outer membrane/exported protein  55.12 
 
 
253 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.457943  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0037  putative outer membrane/hypothetical protein  55.12 
 
 
253 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548328  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0039  putative outer membrane/exported protein  55.12 
 
 
253 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0038  hypothetical protein  55.12 
 
 
253 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163262 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2562  hypothetical protein  31.15 
 
 
254 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0152176  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3097  hypothetical protein  32.2 
 
 
255 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.152183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3059  hypothetical protein  32.2 
 
 
255 aa  99  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000874464  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2788  hypothetical protein  33.61 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2567  hypothetical protein  33.61 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00554266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2682  hypothetical protein  33.61 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2616  hypothetical protein  33.61 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2658  hypothetical protein  33.61 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.550695  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1254  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  31.43 
 
 
254 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000811085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0972  hypothetical protein  32.61 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000604021  decreased coverage  0.000188692 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4026  hypothetical protein  25.73 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0236  hypothetical protein  23.49 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>