58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0032 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0032  ParA protein homolog  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178481  normal  0.176869 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0052  ParA protein  99.07 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.26 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  28.78 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  26.13 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  26.79 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4398  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  23.2 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  23.24 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  29.84 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  29.84 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  29.84 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.84 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  29.84 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  29.84 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  29.84 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  25.27 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.81 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.543877  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  29.84 
 
 		 331 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.23 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.68 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  28.35 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.35 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.23 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1770  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.64 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.56 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.71 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.79 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.56 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.23 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.02 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.56 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.56 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.68 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.56 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  29.36 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.23 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.23 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.23 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.36 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  23.37 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.32 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  23.37 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.41 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.35 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0463481  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.96 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.86 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  28.7 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.63 
 
 		 260 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  22.63 
 
 		 260 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.13 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.13 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>