23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0059 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0059    100 
 
 		 365 bp  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00206792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  82.82 
 
 		 390 bp  272  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  82.82 
 
 		 390 bp  272  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  82.82 
 
 		 390 bp  272  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  82.82 
 
 		 390 bp  272  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  82.82 
 
 		 390 bp  272  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  82.82 
 
 		 390 bp  272  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  82.82 
 
 		 390 bp  272  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  82.82 
 
 		 390 bp  272  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  82.82 
 
 		 390 bp  272  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  82.82 
 
 		 390 bp  272  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  82.69 
 
 		 402 bp  266  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  82.31 
 
 		 402 bp  256  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  82.31 
 
 		 390 bp  256  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  82.31 
 
 		 390 bp  256  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  82.31 
 
 		 390 bp  256  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  82.31 
 
 		 390 bp  256  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4198    82.05 
 
 		 4969 bp  248  9e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4882    81.04 
 
 		 381 bp  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1181  IS66 family element, orf1  94.29 
 
 		 162 bp  161  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1310  IS66 family element, orf1  94.29 
 
 		 162 bp  161  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4290    94.29 
 
 		 960 bp  161  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5041  IS66 family element, orf1  94.29 
 
 		 162 bp  161  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>