23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4966 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4966  tryptophan-specific transport protein  100 
 
 		 78 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000943864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4960  tryptophan-specific transport protein  98.72 
 
 		 78 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000276027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4908  tryptophan-specific transport protein  98.72 
 
 		 78 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000448788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4805  tryptophan-specific transport protein  98.72 
 
 		 78 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000590073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4873  tryptophan-specific transport protein  97.44 
 
 		 78 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000593467  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4962  hypothetical protein  66.67 
 
 		 115 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3629  protein of unknown function DUF1435  65.38 
 
 		 78 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0340884  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04211  hypothetical protein  65.38 
 
 		 78 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04245  hypothetical protein  65.38 
 
 		 78 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0639443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5881  hypothetical protein  65.38 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.030083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4601  hypothetical protein  65.38 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000106391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4910  hypothetical protein  65.38 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.47534e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4914  hypothetical protein  65.38 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000436159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3687  hypothetical protein  65.38 
 
 		 78 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0603064  hitchhiker  0.00012963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0529  hypothetical protein  62.16 
 
 		 76 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0833  protein of unknown function DUF1435  50.77 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0616  hypothetical protein  49.23 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3508  hypothetical protein  45.61 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0646  hypothetical protein  44.16 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3637  hypothetical protein  43.86 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.572492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0842  hypothetical protein  43.86 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3442  hypothetical protein  46.15 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3320  hypothetical protein  43.08 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>