More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4239 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03598  predicted inner membrane protein  82.47 
 
 		 445 aa  681    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4239  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 		 389 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034551  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4253  Xanthine/uracil/vitamin C permease  82.02 
 
 		 445 aa  677    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  85.39 
 
 		 445 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4208  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  82.02 
 
 		 445 aa  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03542  hypothetical protein  82.47 
 
 		 445 aa  681    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4143  xanthine/uracil/vitamin C permease  80.9 
 
 		 446 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4280  xanthine/uracil/vitamin C permease  82.47 
 
 		 445 aa  681    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5145  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  82.25 
 
 		 445 aa  679    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.164927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3928  sulfate permease family inorganic anion transporter  82.47 
 
 		 445 aa  681    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  85.17 
 
 		 445 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4081  sulfate permease family inorganic anion transporter  82.25 
 
 		 445 aa  679    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  85.39 
 
 		 445 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  85.17 
 
 		 445 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4223  sulfate permease family inorganic anion transporter  82.47 
 
 		 445 aa  681    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  72.45 
 
 		 442 aa  600  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.45 
 
 		 442 aa  600  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  72.69 
 
 		 442 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  68.99 
 
 		 445 aa  588  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.01 
 
 		 445 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4275  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.34 
 
 		 445 aa  566  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  68.09 
 
 		 445 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4595  Xanthine/uracil/vitamin C permease  69.66 
 
 		 445 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  62.61 
 
 		 444 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  62.61 
 
 		 470 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  62.61 
 
 		 444 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  62.61 
 
 		 470 aa  538  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  62.61 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0039  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.39 
 
 		 444 aa  537  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.39 
 
 		 444 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  62.39 
 
 		 470 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  54.61 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.73 
 
 		 461 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.56 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.63 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.63 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.86 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  43.93 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.12 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.18 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  45.2 
 
 		 430 aa  358  7e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.99 
 
 		 449 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.33 
 
 		 449 aa  352  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.22 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.29 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.06 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.52 
 
 		 431 aa  349  4e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.06 
 
 		 429 aa  349  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.76 
 
 		 449 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.01 
 
 		 432 aa  348  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.76 
 
 		 449 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.06 
 
 		 429 aa  348  7e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.16 
 
 		 430 aa  348  9e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.76 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  42.06 
 
 		 429 aa  345  8e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  42.86 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.85 
 
 		 431 aa  343  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.12 
 
 		 429 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.36 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.12 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.12 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.12 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.66 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.66 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  42.95 
 
 		 453 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  40.7 
 
 		 449 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  50.32 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.23 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  41.36 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.86 
 
 		 430 aa  329  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  44.86 
 
 		 430 aa  328  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  42.21 
 
 		 453 aa  328  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.63 
 
 		 454 aa  328  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.33 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  41.76 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  40.7 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.76 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  42 
 
 		 433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.64 
 
 		 431 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  47.73 
 
 		 431 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  47.73 
 
 		 431 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.64 
 
 		 431 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  40.93 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.64 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.76 
 
 		 433 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.97 
 
 		 453 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.53 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.53 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.53 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0570  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.52 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.46787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.23 
 
 		 446 aa  319  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.89 
 
 		 431 aa  319  6e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.04 
 
 		 431 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.05 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.83 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.77 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  41.3 
 
 		 433 aa  315  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  41.07 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  41.07 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  41.07 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>