More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3754 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00413  multidrug efflux system protein  80.96 
 
 		 1049 aa  1721    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  64.05 
 
 		 1037 aa  1358    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03124  multidrug efflux system protein  88.77 
 
 		 1034 aa  1866    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03362  multidrug transporter, RpoS-dependent  71.76 
 
 		 1037 aa  1492    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0199  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  71.76 
 
 		 1037 aa  1492    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0440  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  88.77 
 
 		 1034 aa  1867    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  64.05 
 
 		 1037 aa  1358    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3148  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  80.96 
 
 		 1049 aa  1721    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2696  AcrB/AcrD/AcrF family protein  62.88 
 
 		 1052 aa  1338    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  65.48 
 
 		 1050 aa  1402    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2818  multidrug efflux RND transporter MexD  49.9 
 
 		 1042 aa  997    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3456  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  53.25 
 
 		 1042 aa  1056    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.417579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  56.72 
 
 		 1049 aa  1168    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003296  RS01889  drug efflux transmembrane protein  64.67 
 
 		 1053 aa  1345    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0312  multidrug efflux system transmembrane protein  51.57 
 
 		 1049 aa  993    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712007  normal  0.0691835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  47.11 
 
 		 1052 aa  888    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  44.75 
 
 		 1037 aa  873    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  45.02 
 
 		 1051 aa  864    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  64.67 
 
 		 1044 aa  1374    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2592  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.57 
 
 		 1047 aa  992    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.886048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  64.62 
 
 		 1044 aa  1384    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0316  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  65.41 
 
 		 1066 aa  1386    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.611401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2282  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.37 
 
 		 1047 aa  1009    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0161777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2865  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60.81 
 
 		 1048 aa  1244    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536014  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  65 
 
 		 1044 aa  1392    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1576  RND superfmily multidrug/dye/detergent efflux pump AcrB  57.8 
 
 		 1075 aa  1228    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00327215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6289  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  48.08 
 
 		 1076 aa  952    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.72315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3441  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  59.33 
 
 		 1051 aa  1233    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  65.67 
 
 		 1050 aa  1420    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1417  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  65.19 
 
 		 1054 aa  1356    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.83 
 
 		 1053 aa  1013    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0254632  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.42 
 
 		 1057 aa  856    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1019  inner membrane protein  65.51 
 
 		 1066 aa  1390    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2058  multidrug efflux protein  50.24 
 
 		 1043 aa  1052    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  65.07 
 
 		 1054 aa  1378    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2757  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.71 
 
 		 1043 aa  998    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  53.99 
 
 		 1032 aa  1099    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3318  cation efflux transporter  57.86 
 
 		 1039 aa  1157    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0288  acridine efflux pump  62.13 
 
 		 1053 aa  1297    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  64.41 
 
 		 1063 aa  1352    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6824  hydrophobe/amphiphile efflux pump  51.28 
 
 		 1047 aa  992    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78636  normal  0.200306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4768  multidrug efflux protein  50.53 
 
 		 1045 aa  1048    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157004  normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4995  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  45.89 
 
 		 1053 aa  901    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5939  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  65.54 
 
 		 1066 aa  1384    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794955  normal  0.377291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1194  hydrophobe/amphiphile efflux pump protein  63.25 
 
 		 1047 aa  1329    Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000151988  normal  0.324447 
 
 
 
NC_007517  Gmet_0810  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  62.31 
 
 		 1053 aa  1340    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0578255 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1532  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  56.35 
 
 		 1049 aa  1224    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.075861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.1 
 
 		 1057 aa  890    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1118  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.8 
 
 		 1052 aa  1019    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2051  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  65.31 
 
 		 1050 aa  1360    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0681  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  65.32 
 
 		 1066 aa  1385    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2444  multidrug efflux protein  50.78 
 
 		 1043 aa  1059    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.678369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0517  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  64.57 
 
 		 1055 aa  1318    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2239  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  62.16 
 
 		 1048 aa  1301    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.37 
 
 		 1053 aa  995    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.698151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1219  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  54.78 
 
 		 1044 aa  1125    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2065  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  55.48 
 
 		 1052 aa  1116    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1871  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  61.64 
 
 		 1046 aa  1257    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2729  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  51.2 
 
 		 1036 aa  1008    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0409192  normal  0.0822346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1360  multidrug efflux protein  50.67 
 
 		 1037 aa  1030    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.8 
 
 		 1037 aa  860    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  55.95 
 
 		 1059 aa  1137    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.602316  hitchhiker  0.00575958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  64.99 
 
 		 1069 aa  1420    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1743  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  47.11 
 
 		 1084 aa  955    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134866  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2985  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  46.62 
 
 		 1068 aa  936    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.684616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3602  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  62.2 
 
 		 1046 aa  1316    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2681  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.46 
 
 		 1049 aa  980    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0839162  normal  0.444783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.81 
 
 		 1042 aa  1029    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3780  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  48.89 
 
 		 1054 aa  990    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0221065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3538  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50 
 
 		 1056 aa  1005    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1758  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  57.53 
 
 		 1100 aa  1214    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.04251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1121  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.85 
 
 		 1044 aa  903    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  59.92 
 
 		 1050 aa  1262    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3924  multidrug efflux system protein  66.22 
 
 		 1048 aa  1408    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1449  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  52.02 
 
 		 1054 aa  1017    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1143  multidrug efflux protein  50.15 
 
 		 1046 aa  1023    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.829538  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1998  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  65.8 
 
 		 1066 aa  1390    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4471  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  51.18 
 
 		 1047 aa  1019    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5600  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  59.56 
 
 		 1065 aa  1231    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  64.02 
 
 		 1063 aa  1340    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347364  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6372  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.08 
 
 		 1059 aa  907    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3799  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  53.59 
 
 		 1053 aa  1106    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  64.38 
 
 		 1044 aa  1369    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  64.38 
 
 		 1044 aa  1369    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3862  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  63.61 
 
 		 1051 aa  1333    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.395414  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1521  multidrug efflux protein  51.02 
 
 		 1045 aa  1051    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2655  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  65.41 
 
 		 1066 aa  1384    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  67.21 
 
 		 1046 aa  1432    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38410  multidrug efflux protein  50.63 
 
 		 1045 aa  1063    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0368685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60830  multidrug efflux RND transporter MexD  51.07 
 
 		 1043 aa  1026    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1623  multidrug efflux protein  50.15 
 
 		 1046 aa  1023    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1706  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.08 
 
 		 1059 aa  907    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  65.8 
 
 		 1066 aa  1390    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3895  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  51.18 
 
 		 1047 aa  1020    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5964  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  59.66 
 
 		 1065 aa  1233    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6205  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  64.02 
 
 		 1063 aa  1340    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956257  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3679  acriflavin resistance protein  58.25 
 
 		 1057 aa  1211    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.441622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.86 
 
 		 1052 aa  856    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  59.65 
 
 		 1041 aa  1280    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.362215  unclonable  0.00000213823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4045  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  64.47 
 
 		 1044 aa  1373    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>