20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3500 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3500  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.945928  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3325  hypothetical protein  98.95 
 
 
95 aa  196  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3334  hypothetical protein  98.95 
 
 
95 aa  196  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3399  hypothetical protein  98.95 
 
 
95 aa  196  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.951858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3405  hypothetical protein  98.95 
 
 
95 aa  196  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0698  conserved hypothetical protein  77.66 
 
 
95 aa  156  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4311  hypothetical protein  77.66 
 
 
95 aa  156  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3425  hypothetical protein  77.66 
 
 
95 aa  156  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0695  hypothetical protein  77.66 
 
 
95 aa  156  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3468  hypothetical protein  77.66 
 
 
95 aa  156  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3178  hypothetical protein  77.66 
 
 
95 aa  156  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3285  hypothetical protein  76.6 
 
 
95 aa  155  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02874  hypothetical protein  76.6 
 
 
95 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02823  hypothetical protein  76.6 
 
 
95 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3406  hypothetical protein  73.68 
 
 
95 aa  154  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4476  hypothetical protein  45.05 
 
 
97 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3145  hypothetical protein  48.94 
 
 
95 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4191  hypothetical protein  43.96 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0008  hypothetical protein  41.76 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0011  hypothetical protein  40.66 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>