39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3398 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3296  Z-ring-associated protein  98.25 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000920152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3293  Z-ring-associated protein  98.25 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3231  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000246663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3398  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000485906  normal  0.526594 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3219  Z-ring-associated protein  98.25 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000367602  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0799  Z-ring-associated protein  92.98 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3044  Z-ring-associated protein  92.98 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000044208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3238  Z-ring-associated protein  92.98 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000274743  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3069  Z-ring-associated protein  92.98 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.6674200000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3331  Z-ring-associated protein  92.98 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000646117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4203  Z-ring-associated protein  92.98 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02705  hypothetical protein  92.98 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000185889  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02742  cytokinetic ring-localizing protein  92.98 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000149347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0782  protein of unknown function DUF710  92.98 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.86222e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3329  Z-ring-associated protein  87.72 
 
 		 109 aa  104  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000688409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3473  Z-ring-associated protein  77.19 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3592  Z-ring-associated protein  77.19 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0446  Z-ring-associated protein  75.44 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0543  Z-ring-associated protein  73.68 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3921  Z-ring-associated protein  71.93 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000155243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3825  Z-ring-associated protein  70.18 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000023514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0861  Z-ring-associated protein  70.18 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0858  Z-ring-associated protein  70.18 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  2.48615e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  48.94 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  47.83 
 
 		 100 aa  48.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  45.65 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  45.65 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  44.68 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  45.65 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  45.65 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  45.65 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  43.48 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  45.65 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  45.65 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  45.65 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  43.48 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  45.45 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  45.65 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  43.48 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>