66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3209 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3104  invasion protein  100 
 
 		 249 aa  516  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000120777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3089  invasion protein  100 
 
 		 249 aa  516  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.80206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3209  invasion protein  100 
 
 		 249 aa  516  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3052  invasion protein  99.6 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.227762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3021  invasion protein  99.2 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4150  EivF  37.45 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0288495 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1545  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  33.61 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2059  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  33.61 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0827  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  33.89 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781437  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0739  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  35.21 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480247  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2088  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2176  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187611  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0587  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  36.56 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0000113991  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0178  transcriptional regulator MxiE  37.36 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0571394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 154 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 		 760 aa  49.7  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 294 aa  48.5  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 296 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  34.09 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1299  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.736083 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 311 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.31 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 310 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3295  transcriptional regulator, AraC family  24.55 
 
 		 285 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2396  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  34.48 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1945  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  32.22 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2509  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00177278  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  24.78 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0847  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1440  helix-turn-helix, AraC type  28.43 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 361 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  24.44 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  24.44 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2201  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  44.23 
 
 		 348 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 300 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 347 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3263  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.534649  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 292 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 		 276 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  24.32 
 
 		 1335 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  37.88 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 332 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 777 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>