45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2594 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4206  heme exporter protein CcmD  100 
 
 		 57 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2594  heme exporter protein CcmD  100 
 
 		 57 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.341117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2435  hypothetical protein  98.25 
 
 		 70 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.762204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4099  hypothetical protein  98.25 
 
 		 70 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4044  heme exporter protein CcmD  98.25 
 
 		 57 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4027  heme exporter protein CcmD  98.25 
 
 		 57 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2477  heme exporter protein CcmD  98.25 
 
 		 57 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0267675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4148  heme exporter protein CcmD  98.25 
 
 		 57 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2491  heme exporter protein CcmD  98.25 
 
 		 57 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0106744 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2386  heme exporter protein CcmD  95.83 
 
 		 57 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1452  heme exporter protein CcmD  82.46 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2346  heme exporter protein D  82.46 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74557 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2497  heme exporter protein D  82.46 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2336  heme exporter protein D  82.46 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3335  heme exporter protein D  82.46 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02084  hypothetical protein  82.46 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02125  cytochrome c biogenesis protein  82.46 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1461  heme exporter protein CcmD  82.46 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0743  heme exporter protein D  78.95 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4290  heme exporter protein D (CcmD)  42.59 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000529225 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3021  Heme exporter protein D (CcmD)  44.44 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2725  heme exporter protein CcmD  50.98 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2421  heme exporter protein CcmD  49.02 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4662  heme exporter protein CcmD  41.82 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270575  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0242  heme exporter protein CcmD  38.89 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0295502  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0187  Heme exporter protein D (CcmD)  36.36 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000124627  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0260  heme exporter protein CcmD  37.04 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  35.19 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0709378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  35.19 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0178152  normal  0.0518637 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1390  heme exporter protein D  46.43 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0392  heme exporter protein CcmD  46.43 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.376555 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1499  heme exporter protein CcmD  46.43 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.81257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0176  Heme exporter protein D (CcmD)  35.09 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  37.04 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0464589  unclonable  0.0000000000228881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0223  Heme exporter protein D (CcmD)  37.04 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  37.04 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.102118  unclonable  0.0000000000309082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03071  heme exporter protein CcmD  37.25 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0212  Heme exporter protein D (CcmD)  40.74 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126241  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3730  Heme exporter protein D (CcmD)  35.19 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0522398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4027  heme exporter protein CcmD  35.19 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.385371  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  35.19 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0435599  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3572  Heme exporter protein D (CcmD)  39.58 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0932197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3388  Heme exporter protein D (CcmD)  57.89 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.813039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3253  Heme exporter protein D (CcmD)  36.17 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2278  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  33.93 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>