77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2504 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2504  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.705894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2303  putative cytoplasmic protein  99.35 
 
 		 155 aa  317  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2396  putative cytoplasmic protein  99.35 
 
 		 155 aa  317  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.740518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2392  hypothetical protein  99.35 
 
 		 155 aa  317  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.238973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2347  putative cytoplasmic protein  99.35 
 
 		 155 aa  317  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02053  hypothetical protein  89.68 
 
 		 156 aa  290  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02011  hypothetical protein  89.68 
 
 		 156 aa  290  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3111  hypothetical protein  89.68 
 
 		 156 aa  290  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.269934 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0864  hypothetical protein  89.68 
 
 		 156 aa  290  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1523  hypothetical protein  89.68 
 
 		 156 aa  290  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2412  hypothetical protein  89.68 
 
 		 156 aa  290  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2258  hypothetical protein  89.68 
 
 		 156 aa  290  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1534  protein of unknown function DUF1456  89.68 
 
 		 156 aa  290  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0920  hypothetical protein  89.03 
 
 		 156 aa  288  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2722  hypothetical protein  76.97 
 
 		 155 aa  251  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2726  hypothetical protein  64.67 
 
 		 154 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1548  protein of unknown function DUF1456  64.67 
 
 		 153 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.54796  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2795  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2874  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1341  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0612895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1414  hypothetical protein  50.65 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1190  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4019  hypothetical protein  48.34 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1221  hypothetical protein  49.33 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4226  hypothetical protein  48 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1188  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4022  hypothetical protein  46.67 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1389  hypothetical protein  46.67 
 
 		 153 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3062  hypothetical protein  45.1 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.590998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03268  YehS  46.79 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0677  hypothetical protein  44 
 
 		 156 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3633  hypothetical protein  44 
 
 		 156 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.059519  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3565  protein of unknown function DUF1456  44 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52430  hypothetical protein  46 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3756  hypothetical protein  44 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1273  hypothetical protein  47.62 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0737  hypothetical protein  41.83 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3187  hypothetical protein  43.33 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.490113  hitchhiker  0.000481083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4597  hypothetical protein  46 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0785  hypothetical protein  43.33 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0277  protein of unknown function DUF1456  44.74 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0779  hypothetical protein  42.67 
 
 		 156 aa  135  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.023877 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0751  hypothetical protein  42.67 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0266116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3852  hypothetical protein  42 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3517  hypothetical protein  42.67 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0834  hypothetical protein  38.56 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3447  hypothetical protein  42 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0903  hypothetical protein  41.33 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3185  hypothetical protein  41.72 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1323  hypothetical protein  38.1 
 
 		 164 aa  123  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2963  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1514  protein of unknown function DUF1456  43.92 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2620  hypothetical protein  41.22 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.481064  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1917  protein of unknown function DUF1456  40.51 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3749  hypothetical protein  38.16 
 
 		 227 aa  120  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0731  hypothetical protein  42.76 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.406877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2306  protein of unknown function DUF1456  39.87 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0308  hypothetical protein  36.53 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00327546  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3098  hypothetical protein  38 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0103  hypothetical protein  39.46 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.664963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0430  hypothetical protein  36.53 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565594  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00928  hypothetical protein  37.25 
 
 		 226 aa  114  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0321  hypothetical protein  35.93 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000361969  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0336  hypothetical protein  35.93 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000656402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0368  hypothetical protein  35.93 
 
 		 172 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0412  hypothetical protein  35.93 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0430  hypothetical protein  35.93 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0383  hypothetical protein  35.33 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0304  hypothetical protein  35.33 
 
 		 172 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000469765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4936  hypothetical protein  34.73 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00472073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0316  hypothetical protein  34.73 
 
 		 172 aa  103  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1400  hypothetical protein  36.18 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000593967  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1572  hypothetical protein  31.61 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1420  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2166  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0524775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00810  hypothetical protein  46.15 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0798897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1012  protein of unknown function DUF1456  44.62 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>