21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2348 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2348    100 
 
 		 1527 bp  3027    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00192041  hitchhiker  0.00291623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2116    99.21 
 
 		 1527 bp  2932    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000325483  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2183    99.67 
 
 		 1527 bp  2987    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000316364  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2235    98.69 
 
 		 1527 bp  2868    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.026696  normal  0.524207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2171    99.15 
 
 		 1527 bp  2924    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000176458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  79.6 
 
 		 1443 bp  345  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  78.98 
 
 		 1644 bp  268  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  78.98 
 
 		 1644 bp  268  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  79.35 
 
 		 1488 bp  264  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0981    79.35 
 
 		 1107 bp  264  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000022763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  79.22 
 
 		 1455 bp  256  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  78.76 
 
 		 1641 bp  252  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  79.08 
 
 		 1488 bp  248  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  78.76 
 
 		 1641 bp  246  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  78.95 
 
 		 1455 bp  240  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  77.68 
 
 		 1455 bp  198  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  88.33 
 
 		 1425 bp  63.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  81.42 
 
 		 1425 bp  58  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  81.42 
 
 		 1425 bp  58  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  81.42 
 
 		 1431 bp  58  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  86.67 
 
 		 1431 bp  56  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>