148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1313 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2087  ferritin  100 
 
 		 167 aa  347  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1189  ferritin, Dps family protein  100 
 
 		 167 aa  347  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000117552  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1313  ferritin  100 
 
 		 167 aa  347  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000179199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2147  ferritin  100 
 
 		 167 aa  347  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.7739099999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2093  ferritin, Dps family protein  100 
 
 		 167 aa  347  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.991822  hitchhiker  3.99578e-21 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01870  predicted ferritin-like protein  76.65 
 
 		 167 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0471958  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1741  Ferritin Dps family protein  76.65 
 
 		 167 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861271  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01859  hypothetical protein  76.65 
 
 		 167 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0419737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1998  ferritin family protein  76.65 
 
 		 167 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000718923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2133  ferritin family protein  76.65 
 
 		 167 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00478482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1733  Ferritin Dps family protein  76.65 
 
 		 167 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1283  ferritin family protein  76.65 
 
 		 167 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0356049  hitchhiker  0.00000238021 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2638  ferritin family protein  76.05 
 
 		 167 aa  266  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000360651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2478  Ferritin, Dps family protein  67.66 
 
 		 167 aa  240  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  39.24 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  36.6 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  36.71 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  35 
 
 		 168 aa  111  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  36.71 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  36.71 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  36.08 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  36.08 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  36.71 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  34.97 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  36.71 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  36.08 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  36.08 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  35.95 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  36.08 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2138  ferritin  36.08 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000244733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1731  ferritin  36.08 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0712899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  36.71 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  35.53 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  35.95 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  34.64 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  34.81 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1031  ferritin  35.44 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000984451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  33.13 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  33.13 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  33.13 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  33.13 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  34.97 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  33.13 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  35.44 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  33.13 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  33.13 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  33.13 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  34.18 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  34.18 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  33.55 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  34.64 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  34.64 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  34.64 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  33.54 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  32.52 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  33.54 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  32.52 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  31.06 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  30.57 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  32.09 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  28.22 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  28.48 
 
 		 168 aa  84.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  27.95 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  27.95 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  27.95 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  30.23 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  29.11 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  29.93 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  32.56 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  28.1 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  27.45 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  34.75 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  27.22 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  31.54 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  27.22 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  25.32 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2792  Ferritin Dps family protein  26.71 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  27.45 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  30 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  27.27 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2797  Ferritin Dps family protein  23.53 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  28.19 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  27.22 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  27.45 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  26.14 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  26.32 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  28.12 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  28.17 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  27.69 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0690  Ferritin, Dps family protein  26.57 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  27.05 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  26.32 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  25.95 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  26.32 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  26.32 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  26.32 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  26.32 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  26.32 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  26.32 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  26.32 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>