21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4792 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4792  transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4874  AraC family transcriptional regulator  91.46 
 
 		 82 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.62267  hitchhiker  0.00867489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0479  CopG family transcriptional regulator  80.77 
 
 		 82 aa  130  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4743  transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 40 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0586661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0698  CopG family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0592094  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4448  transcriptional regulator, CopG family  39.24 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00107538  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4338  transcriptional regulator, CopG family  39.24 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34669  normal  0.37145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1736  transcriptional regulator, CopG family  39.24 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.814149  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5045  transcriptional regulator, CopG family  39.24 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2208  CopG family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.901295  normal  0.042561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1682  transcriptional regulator, CopG family  36.71 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172973  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6450  CopG family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158963  normal  0.302139 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5345  transcriptional regulator, CopG family  36.99 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.459849 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0022  CopG family protein  35.9 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0092  CopG family protein  35.9 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0262945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5065  transcriptional regulator, CopG family  35.62 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5961  CopG family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  42.03 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  36.11 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0036  transcriptional regulator, CopG family  31.65 
 
 		 90 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0145  CopG family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>