More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4314 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4399  GntR family regulatory protein  99.58 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4314  putative regulatory protein, GntR family  100 
 
 		 240 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4466  GntR family regulatory protein  100 
 
 		 240 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4285  putative regulatory protein GntR family  99.58 
 
 		 240 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4397  putative regulatory protein  98.75 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  30.67 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  30.67 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.67 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.67 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.46 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  26.69 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1740  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 288 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000284043 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.33 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2299  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.171843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.35 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  26.77 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.39 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03128  histidine utilization repressor  28.78 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  26.67 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  23.74 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  25.22 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  28.21 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  24.3 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 266 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6056  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00777479  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  21.24 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  26.38 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  25.5 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  27.49 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  27.49 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  23.81 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  24.66 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4176  GntR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  25.23 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  23.95 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2284  transcriptional regulator, GntR family  26.91 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  25.31 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  25.32 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  23.61 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  25.24 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  25.24 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  23.61 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  23.61 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>