79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1867 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1897  succinylarginine dihydrolase  85.46 
 
 
447 aa  799    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01702  hypothetical protein  85.23 
 
 
447 aa  796    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2463  succinylarginine dihydrolase  84.79 
 
 
447 aa  794    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.849491 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2040  succinylarginine dihydrolase  99.78 
 
 
447 aa  912    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1867  succinylarginine dihydrolase  100 
 
 
447 aa  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1401  succinylarginine dihydrolase  99.11 
 
 
447 aa  906    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587954  normal  0.224315 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1433  succinylarginine dihydrolase  99.55 
 
 
447 aa  910    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1418  succinylarginine dihydrolase  100 
 
 
447 aa  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1991  succinylarginine dihydrolase  85.84 
 
 
453 aa  799    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1446  succinylarginine dihydrolase  84.79 
 
 
447 aa  794    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.555371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1887  succinylarginine dihydrolase  85.23 
 
 
447 aa  794    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0206768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1967  succinylarginine dihydrolase  84.34 
 
 
447 aa  786    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1828  succinylarginine dihydrolase  84.56 
 
 
447 aa  790    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1699  succinylarginine dihydrolase  76.42 
 
 
441 aa  691    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01714  succinylarginine dihydrolase  85.23 
 
 
447 aa  796    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2841  succinylarginine dihydrolase  67.49 
 
 
446 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0487  succinylarginine dihydrolase  64.88 
 
 
449 aa  589  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2118  succinylarginine dihydrolase  65.77 
 
 
447 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2226  succinylarginine dihydrolase  65.77 
 
 
447 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2517  succinylarginine dihydrolase  65.77 
 
 
447 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.658735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3671  succinylarginine dihydrolase  58.3 
 
 
448 aa  528  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3561  succinylarginine dihydrolase  58.52 
 
 
448 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0211379  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4477  succinylarginine dihydrolase  58.17 
 
 
449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.146428 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0073  succinylarginine dihydrolase  56.98 
 
 
444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1836  succinylarginine dihydrolase  58.3 
 
 
448 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3982  succinylarginine dihydrolase  57.72 
 
 
449 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282024  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1438  succinylarginine dihydrolase  58.17 
 
 
449 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531333  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2907  succinylarginine dihydrolase  57.59 
 
 
448 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254862  normal  0.617439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3766  succinylarginine dihydrolase  57.49 
 
 
449 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283643  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4616  succinylarginine dihydrolase  58.52 
 
 
448 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52660  succinylarginine dihydrolase  58.52 
 
 
448 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1321  succinylarginine dihydrolase  56.08 
 
 
444 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0233544  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1779  succinylarginine dihydrolase  57.85 
 
 
446 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0595  succinylarginine dihydrolase  57.62 
 
 
446 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2421  succinylarginine dihydrolase  57.62 
 
 
446 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2870  succinylarginine dihydrolase  57.62 
 
 
446 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2723  succinylarginine dihydrolase  57.62 
 
 
446 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2781  succinylarginine dihydrolase  57.62 
 
 
446 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1732  succinylarginine dihydrolase  57.62 
 
 
446 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.728912  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1783  succinylarginine dihydrolase  56.95 
 
 
446 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2842  succinylarginine dihydrolase  57.62 
 
 
446 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2919  succinylarginine dihydrolase  56.95 
 
 
446 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.342556 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2329  succinylarginine dihydrolase  53.15 
 
 
444 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.217972  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4281  succinylarginine dihydrolase  55.83 
 
 
448 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2120  succinylarginine dihydrolase  56.5 
 
 
446 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.949409 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1065  succinylarginine dihydrolase  56.05 
 
 
446 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230821  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1562  succinylarginine dihydrolase  55.83 
 
 
446 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02354  succinylarginine dihydrolase  54.61 
 
 
446 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0061994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1161  succinylarginine dihydrolase  56.05 
 
 
446 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0804902 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1854  succinylarginine dihydrolase  54.28 
 
 
444 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000137714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1584  succinylarginine dihydrolase  53.38 
 
 
444 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0917284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1659  succinylarginine dihydrolase  53.38 
 
 
444 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.149262  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2479  succinylarginine dihydrolase  53.6 
 
 
444 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913037  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1065  succinylarginine dihydrolase  56.05 
 
 
446 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1728  succinylarginine dihydrolase  53.38 
 
 
444 aa  482  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4295  succinylarginine dihydrolase  56.28 
 
 
446 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569596  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3315  succinylarginine dihydrolase  56.36 
 
 
446 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2497  succinylarginine dihydrolase  54.28 
 
 
444 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2610  succinylarginine dihydrolase  53.83 
 
 
444 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0460868  hitchhiker  0.00355964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2706  succinylarginine dihydrolase  53.15 
 
 
444 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1184  succinylarginine dihydrolase  55.83 
 
 
446 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2225  succinylarginine dihydrolase  51.91 
 
 
445 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2251  succinylarginine dihydrolase  53.38 
 
 
444 aa  478  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2490  succinylarginine dihydrolase  53.83 
 
 
444 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0705  succinylarginine dihydrolase  55.83 
 
 
446 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2842  succinylarginine dihydrolase  52.58 
 
 
445 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355282  hitchhiker  0.000000291277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1534  succinylarginine dihydrolase  52.58 
 
 
445 aa  478  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1802  succinylarginine dihydrolase  52.36 
 
 
445 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.303487  hitchhiker  0.0000138557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2804  succinylarginine dihydrolase  55.13 
 
 
447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2357  succinylarginine dihydrolase  53.26 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119707  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1673  succinylarginine dihydrolase  49.22 
 
 
448 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1667  succinylarginine dihydrolase  48.99 
 
 
448 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1594  succinylarginine dihydrolase  51.35 
 
 
447 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1855  succinylarginine dihydrolase  50 
 
 
446 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.367441  normal  0.80763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0626  succinylarginine dihydrolase  50.34 
 
 
447 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00494853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2204  succinylarginine dihydrolase  48.87 
 
 
447 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.5143  normal  0.200224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0527  succinylarginine dihydrolase  46.38 
 
 
424 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258432  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1941  succinylarginine dihydrolase  43.13 
 
 
415 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0882  succinylarginine dihydrolase  42.96 
 
 
421 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.465376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>