More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1107 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1107  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
162 aa  335  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4419  GCN5-related N-acetyltransferase  58.23 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3080  GCN5-related N-acetyltransferase  57.59 
 
 
168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3860  GCN5-related N-acetyltransferase  55.35 
 
 
162 aa  189  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1930  GCN5-related N-acetyltransferase  56.79 
 
 
164 aa  185  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal  0.122067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2126  GCN5-related N-acetyltransferase  56.41 
 
 
165 aa  181  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3190  GCN5-related N-acetyltransferase  51.88 
 
 
163 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000268617  hitchhiker  0.000000000574174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1712  GCN5-related N-acetyltransferase  50.6 
 
 
170 aa  167  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.341654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  47.83 
 
 
165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2800  GCN5-related N-acetyltransferase  49.69 
 
 
177 aa  158  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0162  acetyltransferase, GNAT family protein  50.96 
 
 
164 aa  157  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0300  acetyltransferase, gnat family protein  50.96 
 
 
164 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0847  GCN5-related N-acetyltransferase  47.83 
 
 
165 aa  157  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0910  GCN5-related N-acetyltransferase  49.07 
 
 
165 aa  156  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329929  normal  0.100371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5535  GCN5-related N-acetyltransferase  45.4 
 
 
168 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0344  GCN5-related N-acetyltransferase  45.4 
 
 
177 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 
150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172633  normal  0.38556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2852  GCN5-related protein N-acetyltransferase  48.7 
 
 
181 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.586337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14680  sortase-like acyltransferase  48.43 
 
 
166 aa  147  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 
302 aa  143  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1662  polyprenyl synthetase  42.14 
 
 
165 aa  138  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00255661  unclonable  0.000000000000112216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.111313  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1661  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105991  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2994  GCN5-related N-acetyltransferase  35.54 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3518  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 
174 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6053  GCN5-related N-acetyltransferase  35.15 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134247  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0397  phosphinothricin acetyltransferase protein  33.94 
 
 
183 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456114  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1649  acetyltransferase  31.06 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.336507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  31.65 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1596  acetyltransferase  30.43 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0382  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.179689  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1883  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.278862  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104009  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1472  Phosphinothricin acetyltransferase  33.94 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1268  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1276  phosphinothricin acetyltransferase, putative  29.38 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4184  acetyltransferase  32.7 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1356  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.181273  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1606  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0984019  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
183 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1861  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
177 aa  73.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1335  sortase related acyltransferase  27.5 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
184 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0868  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919602  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2852  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003223  toxin resistance protein  27.67 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3321  phosphinothricin N-acetyltransferase  33.33 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0173112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
179 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3636  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0935  toxin resistance protein  27.33 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0183457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3356  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1401  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0996  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3154  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0087  phosphinothricin N-acetyltransferase  32.93 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0089  phosphinothricin N-acetyltransferase  32.93 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32151  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1469  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1274  Phosphinothricin acetyltransferase  29.45 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2733  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
184 aa  67.4  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
193 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00885  phosphinothricin N-acetyltransferase  32.3 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3272  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3653  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2997  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3936  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0390446  decreased coverage  0.000407903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3327  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.796902  normal  0.13657 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1467  phosphinothricin N-acetyltransferase  28.57 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0493  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.691777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1689  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.89212  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0287  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1274  phosphinothricin N-acetyltransferase  27.95 
 
 
247 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2530  phosphinothricin N-acetyltransferase  27.95 
 
 
247 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
195 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0345136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2931  Phosphinothricin acetyltransferase  27.95 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4059  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
207 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0540643  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1103  putative phosphinothricin acetyltransferase  32.1 
 
 
190 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1352  phosphinothricin N-acetyltransferase  27.95 
 
 
247 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1014  phosphinothricin N-acetyltransferase  27.95 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
202 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.772971 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0284  phosphinothricin N-acetyltransferase  27.95 
 
 
247 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>