More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1059 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1059  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 210 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  62.2 
 
 		 208 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  62.2 
 
 		 208 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  62.2 
 
 		 208 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  61.24 
 
 		 208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  62.62 
 
 		 208 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  61.84 
 
 		 207 aa  268  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  63.11 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  62.32 
 
 		 207 aa  263  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  62.32 
 
 		 207 aa  261  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  42.71 
 
 		 208 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  38.65 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  37.26 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  38.16 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  38.83 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  37.86 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.61 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  38.22 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  37.86 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  37.86 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  37.86 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  37.86 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  38.54 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  38.05 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.93 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  35.89 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.45 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.76 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  39.69 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  36.62 
 
 		 209 aa  131  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  37.32 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  40.67 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  37.09 
 
 		 206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.79 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.85 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  38.69 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.72 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.71 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  38.35 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 		 203 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 		 217 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.71 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.38 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.68 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.25 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  37.69 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  36.45 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  37.69 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  43.31 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.68 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3172  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.62 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.18 
 
 		 216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  35.27 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.43 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1108  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  36.65 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  34.93 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 		 242 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  34.3 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.81 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.27 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  35.18 
 
 		 208 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.66 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  35.07 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  33.66 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  34.47 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  35.18 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  35.18 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  36.5 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  36.5 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.65 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1385  LysE family amino acid efflux protein  42.28 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159501  normal  0.0685235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  35.85 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  34.78 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.07 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.17 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.17 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.17 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.17 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  35.5 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  42.45 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>