More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0537 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4518  PhoH family protein  68.33 
 
 		 478 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0576  PhoH family protein  84.91 
 
 		 464 aa  811    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3789  PhoH family protein  85.34 
 
 		 464 aa  817    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3732  PhoH family protein  85.34 
 
 		 464 aa  817    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0536  PhoH family protein  85.34 
 
 		 464 aa  817    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0458  PhoH family protein  81.68 
 
 		 464 aa  803    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.774796 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0537  PhoH-like protein  100 
 
 		 464 aa  956    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.874296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0626  PhoH family protein  81.25 
 
 		 464 aa  769    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0576  PhoH family protein  85.13 
 
 		 464 aa  812    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3454  PhoH family protein  85.13 
 
 		 464 aa  813    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3507  PhoH family protein  84.91 
 
 		 464 aa  813    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3915  PhoH family protein  85.34 
 
 		 464 aa  817    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4323  PhoH family protein  82.11 
 
 		 464 aa  806    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0575  PhoH family protein  85.13 
 
 		 464 aa  813    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3130  PhoH family protein  81.68 
 
 		 463 aa  779    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3703  PhoH family protein  82.33 
 
 		 464 aa  792    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3301  PhoH family protein  84.48 
 
 		 464 aa  810    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2090  hypothetical protein  65.95 
 
 		 458 aa  614  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03677  hypothetical protein  64.81 
 
 		 458 aa  609  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3829  PhoH-like protein  66.88 
 
 		 465 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0815291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002391  PhoH family protein  64.29 
 
 		 458 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03696  PhoH family protein  65.66 
 
 		 428 aa  551  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1040  PhoH family protein  50.32 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1246  PhoH-like protein  51.64 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1189  hypothetical protein  52.08 
 
 		 463 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.541896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13190  hypothetical protein  52.08 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0491409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1066  PhoH-like protein  51.64 
 
 		 464 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.128734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11240  PhoH-like protein  51.31 
 
 		 464 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.653807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1033  PhoH family protein  50.55 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0963  PhoH-like protein  50.55 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4558  PhoH family protein  49.89 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1291  PhoH family protein  50.11 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0898  PhoH family protein  50.76 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0886799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4434  PhoH family protein  50.11 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.879472 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2341  PhoH family protein  50.11 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319227  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1210  PhoH-like protein  43.52 
 
 		 473 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0663  PhoH family protein  44.02 
 
 		 469 aa  354  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.860719  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2186  PhoH-like protein  42.71 
 
 		 562 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2901  hypothetical protein  43.16 
 
 		 468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2754  hypothetical protein  42.92 
 
 		 468 aa  353  5e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1234  PhoH family protein  42.58 
 
 		 494 aa  349  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5223  PhoH family protein  42.46 
 
 		 605 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2563  PhoH family protein  42.28 
 
 		 587 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388197  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3210  PhoH family protein  42.28 
 
 		 587 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0428  PhoH family protein  40.9 
 
 		 548 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0593193  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1537  PhoH-like ATPase  43.16 
 
 		 562 aa  345  8e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2235  PhoH family protein  41.86 
 
 		 561 aa  344  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0299193  hitchhiker  0.000000485186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1908  PhoH-like protein  42.24 
 
 		 605 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2309  PhoH-like protein  42.34 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0987  PhoH family protein  42.86 
 
 		 575 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  42.62 
 
 		 465 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1970  PhoH-like protein  42.46 
 
 		 564 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.368565  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1252  PhoH family protein  41.7 
 
 		 575 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00804597  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1191  PhoH family protein  41.7 
 
 		 575 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171726  normal  0.0177982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0920  PhoH family protein  43.46 
 
 		 606 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.244887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6214  PhoH-like protein  43.51 
 
 		 600 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1889  PhoH family protein  43.51 
 
 		 600 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.835175  hitchhiker  0.000000118582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1865  PhoH family protein  43.51 
 
 		 600 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1775  PhoH family protein  43.7 
 
 		 606 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1803  PhoH family protein  44.03 
 
 		 606 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1316  hypothetical protein  41.7 
 
 		 572 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2187  PhoH family protein  43.49 
 
 		 631 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2243  PhoH family protein  43.49 
 
 		 597 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1886  PhoH family protein  43.46 
 
 		 544 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2282  PhoH family protein  43.46 
 
 		 544 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293655  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1997  PhoH-like protein  42.4 
 
 		 567 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2407  PhoH family protein  43.46 
 
 		 628 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1795  PhoH family protein  42.23 
 
 		 616 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0220004 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1159  PhoH family protein  43.46 
 
 		 544 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613186  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0010  PhoH family protein  43.46 
 
 		 544 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5166  PhoH-like protein  43.25 
 
 		 600 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1408  PhoH family protein  43.28 
 
 		 601 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.545496  normal  0.312062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2582  PhoH family protein  41.36 
 
 		 492 aa  333  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1946  PhoH-like protein  40.85 
 
 		 483 aa  333  5e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1396  PhoH family protein  43.28 
 
 		 597 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2392  putative ATPase, PhoH-like protein  41.68 
 
 		 564 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0563545 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2029  PhoH family protein  41.19 
 
 		 573 aa  330  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.877213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0413  PhoH family protein  40.88 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.205876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1222  PhoH-like protein  40.85 
 
 		 475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1508  PhoH family protein  42.83 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00130  PhoH family protein  42.58 
 
 		 465 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.06025  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0641  PhoH family protein  41.77 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0328663  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1554  PhoH-like protein  41.53 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000065778  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1185  PhoH family protein  39.96 
 
 		 469 aa  325  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.940531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1469  PhoH family protein  39.96 
 
 		 469 aa  325  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1827  PhoH family protein  40.25 
 
 		 595 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2200  PhoH family protein  40.21 
 
 		 444 aa  316  5e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.033076  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0342  hypothetical protein  40.65 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2481  PhoH family protein  38.63 
 
 		 450 aa  307  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1110  PhoH-like protein  38.85 
 
 		 522 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0824  PhoH-like protein  40.29 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10930  PhoH family protein  36.36 
 
 		 439 aa  259  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0148  PhoH family protein  36.88 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000131616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1302  PhoH-like protein  36.42 
 
 		 439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000664986  normal  0.0143296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2311  PhoH family protein  34.55 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.805307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1866  phoH family protein  35.79 
 
 		 440 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.086625  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0022  PhoH family protein  33.62 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0479  PhoH family protein  36.46 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2653  PhoH family protein  34.53 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.294096  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2961  PhoH family protein  36.54 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>