More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0056 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0056  ATPase FliI/YscN  100 
 
 		 436 aa  881    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.1679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  40.63 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  41.79 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  40.9 
 
 		 447 aa  302  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  40.75 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  39.67 
 
 		 426 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  42.09 
 
 		 433 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  41.93 
 
 		 450 aa  299  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  44.35 
 
 		 465 aa  298  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  39.23 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  40.1 
 
 		 440 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0080  FliI/YscN family ATPase  44.03 
 
 		 445 aa  296  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  37.41 
 
 		 437 aa  296  7e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  40.48 
 
 		 434 aa  295  8e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  39.53 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  42.04 
 
 		 444 aa  294  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  40.05 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0553  ATPase FliI/YscN  40.79 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  40.46 
 
 		 449 aa  293  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  39.12 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  43.05 
 
 		 422 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  39.81 
 
 		 487 aa  292  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  38.61 
 
 		 427 aa  292  9e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  43.23 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  40.75 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  39 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  42.25 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  40.48 
 
 		 437 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  39.43 
 
 		 442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3656  ATPase FliI/YscN  40.89 
 
 		 445 aa  289  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  40.8 
 
 		 439 aa  288  9e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  40.13 
 
 		 486 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3473  FliI/YscN family ATPase  43.5 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.906241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  42.71 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  41.33 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  44.15 
 
 		 446 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  40.42 
 
 		 437 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  40.16 
 
 		 443 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  38.65 
 
 		 443 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  39.01 
 
 		 434 aa  285  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  40.1 
 
 		 456 aa  285  8e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  39.01 
 
 		 434 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  42.71 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  41.84 
 
 		 445 aa  285  9e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  42.67 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  42.67 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  38.01 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  39.79 
 
 		 437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  42.93 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  43 
 
 		 439 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  42.75 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  42.13 
 
 		 448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  41.29 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  39.34 
 
 		 466 aa  283  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  41.61 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2978  flagellar protein export ATPase FliI  41.2 
 
 		 513 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  42.93 
 
 		 446 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  42.67 
 
 		 451 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  39.79 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  39.77 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  40.68 
 
 		 448 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  39.77 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  39.52 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  39.77 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  39.77 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  39.77 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  42.42 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  42.4 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  42.18 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  38.25 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1391  ATPase FliI/YscN  40.65 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00127996  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1116  flagellar protein export ATPase FliI  39.91 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  38.78 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3112  flagellar protein export ATPase FliI  42.13 
 
 		 513 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1640  flagellar protein export ATPase FliI  39.47 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.117253  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  43.19 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  40.28 
 
 		 478 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1649  ATPase FliI/YscN  42.11 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  41.47 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  41.47 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  43.6 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3064  flagellar protein export ATPase FliI  42.13 
 
 		 524 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  43.6 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  41.89 
 
 		 513 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  41.89 
 
 		 513 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  43.6 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  43.6 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  43.6 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  40.74 
 
 		 514 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  41.65 
 
 		 519 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  38.28 
 
 		 456 aa  280  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  38.28 
 
 		 456 aa  279  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  40.62 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  40.1 
 
 		 453 aa  279  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  39.8 
 
 		 472 aa  279  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  40 
 
 		 446 aa  279  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  36.62 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24200  Flagellum-specific ATPase  39.86 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00829367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2466  ATPase, FliI/YscN family  40.4 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00501836  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2562  ATPase FliI/YscN  40.4 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00881379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>