More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0046 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0046  protein of unknown function DUF1078-like protein  100 
 
 		 253 aa  508  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.88 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.88 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  37.12 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.02 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.85 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  36.88 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.78 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.78 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.78 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.78 
 
 		 260 aa  171  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  34.98 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  35.36 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  35.74 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.97 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  35.63 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  35.63 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.48 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.59 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.48 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.5 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  37.64 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  37.64 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  37.64 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.12 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  37.64 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  37.64 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  37.64 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  37.64 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  36.4 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  34.22 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  37.26 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  35.25 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  35.94 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.68 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0154  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.02 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.469359  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.68 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  37.12 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  37.12 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0515  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.91 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.308837  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  34.98 
 
 		 262 aa  161  7e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.91 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2923  flagellar basal-body rod FlgG  34.22 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  36.26 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  36.26 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.87 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  36.4 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  36.26 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.29 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  36.26 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2264  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.85 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  35.91 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  34.22 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.25 
 
 		 260 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.71 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  36.78 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.21 
 
 		 266 aa  156  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.58 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.35 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.35 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.59 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  37.12 
 
 		 262 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1156  flagellar basal body rod protein FlgG  34.48 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  34.88 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.5 
 
 		 262 aa  155  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.75 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  35.77 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  35.77 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  36.74 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  35.38 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0268  flagellar basal body rod protein FlgG  35.57 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2912  flagellar basal body rod protein FlgG  33.07 
 
 		 261 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  35 
 
 		 261 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  33.97 
 
 		 266 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 		 261 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 		 261 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  34.87 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  33.96 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  34.48 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3366  flagellar basal body rod protein FlgG  35.18 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.06 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.58 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.63 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  33.08 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.08 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  35.5 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1959  flagellar basal-body rod FlgG  34.73 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  34.1 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.73 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4197  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4676  flagellar basal body rod protein FlgG  33.97 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103998 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0189  flagellar basal body rod protein FlgG  34.22 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0242  flagellar basal body rod protein FlgG  34.22 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3245  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.63 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  35.27 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  35.27 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  31.18 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  34.13 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>