More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0044 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0044  type III secretion FHIPEP  100 
 
 		 680 aa  1365    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2262  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.23 
 
 		 695 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.85 
 
 		 695 aa  479  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.89 
 
 		 692 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.42 
 
 		 686 aa  472  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.52 
 
 		 695 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.72 
 
 		 692 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.11 
 
 		 694 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.54 
 
 		 711 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.6 
 
 		 692 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.54 
 
 		 694 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.97 
 
 		 696 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.27 
 
 		 690 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.79 
 
 		 686 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.13 
 
 		 702 aa  450  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.81 
 
 		 690 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.65 
 
 		 708 aa  448  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.05 
 
 		 689 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.54 
 
 		 697 aa  445  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.57 
 
 		 693 aa  445  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.52 
 
 		 680 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.89 
 
 		 696 aa  439  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1138  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.24 
 
 		 717 aa  438  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.501874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4134  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.26 
 
 		 688 aa  435  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000385225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.21 
 
 		 695 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.96 
 
 		 720 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.69 
 
 		 690 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31020  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.69 
 
 		 686 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2007  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.79 
 
 		 687 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.877962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.61 
 
 		 695 aa  429  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.68 
 
 		 693 aa  428  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.96 
 
 		 710 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.98 
 
 		 708 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.37 
 
 		 703 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.26 
 
 		 678 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0049  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 696 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.24 
 
 		 680 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.23 
 
 		 697 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.4 
 
 		 678 aa  419  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.14 
 
 		 699 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.58 
 
 		 698 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.48 
 
 		 676 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.78 
 
 		 682 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.18 
 
 		 695 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  35.56 
 
 		 694 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.25 
 
 		 699 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.34 
 
 		 692 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.51 
 
 		 673 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.17 
 
 		 708 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.09 
 
 		 696 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.59 
 
 		 694 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.47 
 
 		 679 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.17 
 
 		 708 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.93 
 
 		 698 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.19 
 
 		 694 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.05 
 
 		 693 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.19 
 
 		 694 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.02 
 
 		 700 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.85 
 
 		 699 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0761  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.39 
 
 		 696 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417775  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1132  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.09 
 
 		 723 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2695  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.05 
 
 		 677 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.28 
 
 		 681 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1438  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.72 
 
 		 680 aa  411  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.937514  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  35.49 
 
 		 696 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.25 
 
 		 710 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.42 
 
 		 709 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1118  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.77 
 
 		 695 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.67 
 
 		 705 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.48 
 
 		 710 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  35 
 
 		 706 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.73 
 
 		 697 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1160  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.41 
 
 		 694 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0931  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.9 
 
 		 697 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.38 
 
 		 690 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.02 
 
 		 703 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.45 
 
 		 702 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.79 
 
 		 700 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.28 
 
 		 744 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0704  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.71 
 
 		 688 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1748  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.08 
 
 		 692 aa  405  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2153  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.54 
 
 		 678 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.55 
 
 		 714 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.619596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.76 
 
 		 724 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.82 
 
 		 699 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.59 
 
 		 700 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.24 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  35 
 
 		 699 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0702  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.56 
 
 		 697 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.628209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.79 
 
 		 700 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.35 
 
 		 711 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1700  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.38 
 
 		 696 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1619  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.44 
 
 		 700 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0622  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.56 
 
 		 698 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0243  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.41 
 
 		 698 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0111317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.23 
 
 		 699 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.14 
 
 		 696 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0724  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.66 
 
 		 723 aa  397  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0457553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.94 
 
 		 693 aa  399  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4426  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.1 
 
 		 698 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.47767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>