23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0035 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0035  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  179  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0035  hypothetical protein  52.38 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000637046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0041  hypothetical protein  45.05 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000318858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0048  hypothetical protein  47.13 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00169454  normal  0.150477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3726  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00243512  hitchhiker  0.00809749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0044  hypothetical protein  41.49 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000282672  normal  0.843809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0053  hypothetical protein  41.86 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00250701  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0044  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000193062  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0038  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000159242  hitchhiker  0.000533076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0036  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000153863  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0041  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0040  protein of unknown function DUF1488  43.33 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00230269  unclonable  0.00000000000350952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0036  hypothetical protein  43.33 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0051156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0040  hypothetical protein  43.33 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000215973  unclonable  0.0000087148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0041  hypothetical protein  43.33 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00282046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0033  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000298861  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2462  hypothetical protein  35.56 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000144431  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0084  hypothetical protein  40.35 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.170525  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3669  hypothetical protein  34.09 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00836834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3597  putative periplasmic protein  32.95 
 
 		 85 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000115268  normal  0.951119 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3596  putative periplasmic protein  32.95 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000934197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3767  hypothetical protein  32.95 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00207623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3704  hypothetical protein  31.82 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000244931  normal  0.014665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>