More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2189 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2189  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  100 
 
 		 451 aa  934    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1815  glutamate dehydrogenase  67.55 
 
 		 452 aa  638    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0886  glutamate dehydrogenase  66.37 
 
 		 452 aa  622  1e-177  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1510  glutamate dehydrogenase  66.07 
 
 		 450 aa  616  1e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.299473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1557  glutamate dehydrogenase  66.81 
 
 		 454 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1152  glutamate dehydrogenase  67.29 
 
 		 449 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1290  glutamate dehydrogenase  64.08 
 
 		 455 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1895  glutamate dehydrogenase  64.59 
 
 		 450 aa  598  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0345  glutamate dehydrogenase  64.22 
 
 		 453 aa  599  1e-170  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000352  NADP-specific glutamate dehydrogenase  65.1 
 
 		 450 aa  599  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0286  glutamate dehydrogenase  62.81 
 
 		 450 aa  596  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000707094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0467  glutamate dehydrogenase  62.22 
 
 		 450 aa  560  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000753679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0826  glutamate dehydrogenase  61.07 
 
 		 444 aa  553  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0743965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4852  glutamate dehydrogenase  59.47 
 
 		 444 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1801  glutamate dehydrogenase  58.8 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250235  normal  0.676275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1770  glutamate dehydrogenase  59.07 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1556  glutamate dehydrogenase  59.96 
 
 		 445 aa  541  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1499  glutamate dehydrogenase  59.07 
 
 		 448 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.981406  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1813  glutamate dehydrogenase  57.43 
 
 		 454 aa  543  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2051  glutamate dehydrogenase  60.53 
 
 		 451 aa  544  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.553496 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1335  glutamate dehydrogenase  59.33 
 
 		 449 aa  536  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.26176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0942  glutamate dehydrogenase  57.21 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2430  glutamate dehydrogenase  58.8 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0374  glutamate dehydrogenase  61.29 
 
 		 444 aa  534  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07080  glutamate dehydrogenase  57.68 
 
 		 443 aa  532  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.813 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1427  glutamate dehydrogenase  59.08 
 
 		 448 aa  527  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0175  glutamate dehydrogenase  57.81 
 
 		 449 aa  527  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000304056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0864  glutamate dehydrogenase  57.52 
 
 		 448 aa  525  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.342064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0193  glutamate dehydrogenase  57.81 
 
 		 449 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0573  glutamate dehydrogenase  58.41 
 
 		 448 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2782  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  60.64 
 
 		 446 aa  521  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000238369  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0610  glutamate dehydrogenase  58.8 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0818  glutamate dehydrogenase  57.05 
 
 		 447 aa  524  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1305  glutamate dehydrogenase  57.74 
 
 		 450 aa  519  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3000  glutamate dehydrogenase  57.08 
 
 		 448 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.741284  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2800  glutamate dehydrogenase  58.04 
 
 		 449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00630068  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10490  glutamate dehydrogenase  55.9 
 
 		 451 aa  514  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3497  glutamate dehydrogenase  58.94 
 
 		 451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0302  glutamate dehydrogenase  57.3 
 
 		 449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4646  glutamate dehydrogenase  55.8 
 
 		 448 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2296  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  56.19 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3118  glutamate dehydrogenase  56.64 
 
 		 449 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3219  glutamate dehydrogenase  56.42 
 
 		 449 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1186  glutamate dehydrogenase  57.94 
 
 		 450 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3019  glutamate dehydrogenase  56.64 
 
 		 449 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3443  glutamate dehydrogenase  54.46 
 
 		 450 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0271  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  57.56 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4267  glutamate dehydrogenase  55.8 
 
 		 448 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292709  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2123  glutamate dehydrogenase  57.52 
 
 		 449 aa  512  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4353  glutamate dehydrogenase  55.8 
 
 		 448 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  0.0129009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1371  glutamate dehydrogenase  56.98 
 
 		 452 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1658  glutamate dehydrogenase  57.34 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  55.3 
 
 		 449 aa  505  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542579  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0527  glutamate dehydrogenase  54.19 
 
 		 450 aa  506  9.999999999999999e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000275062  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2911  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  57.11 
 
 		 445 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30790  glutamate dehydrogenase  55.63 
 
 		 447 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0418  glutamate dehydrogenase  55.58 
 
 		 449 aa  501  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1929  glutamate dehydrogenase  57.95 
 
 		 449 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3872  glutamate dehydrogenase  58.6 
 
 		 453 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0346  glutamate dehydrogenase  54.65 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2125  glutamate dehydrogenase  56.98 
 
 		 447 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0411981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2359  glutamate dehydrogenase  55.31 
 
 		 444 aa  495  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34200  glutamate dehydrogenase (NADP)  56.31 
 
 		 446 aa  497  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4667  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  54.87 
 
 		 449 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0996  glutamate dehydrogenase  57.34 
 
 		 451 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3505  glutamate dehydrogenase  55.53 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4804  glutamate dehydrogenase  54.24 
 
 		 449 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5321  glutamate dehydrogenase  56.71 
 
 		 449 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3577  glutamate dehydrogenase  55.53 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0060  glutamate dehydrogenase  53.32 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.742683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0396  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  53.52 
 
 		 447 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5228  glutamate dehydrogenase  53.96 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60710  glutamate dehydrogenase  54.19 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1771  glutamate dehydrogenase  53.42 
 
 		 445 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  0.439156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0675  glutamate dehydrogenase  53.11 
 
 		 449 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32600  glutamate dehydrogenase  54.36 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5524  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  54.46 
 
 		 447 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148438  normal  0.115697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14650  glutamate dehydrogenase  52.01 
 
 		 451 aa  481  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.287682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4509  glutamate dehydrogenase  53.33 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0706  glutamate dehydrogenase  53.11 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02515  glutamate dehydrogenase  54.19 
 
 		 447 aa  481  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0707  glutamate dehydrogenase  52.89 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.469869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4874  glutamate dehydrogenase  53.42 
 
 		 445 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1647  glutamate dehydrogenase  53.1 
 
 		 451 aa  475  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2214  glutamate dehydrogenase  55 
 
 		 438 aa  472  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.171409  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1339  glutamate dehydrogenase  53.2 
 
 		 449 aa  471  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.852226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0527  glutamate dehydrogenase  53.44 
 
 		 447 aa  471  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000736482  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16151  glutamate dehydrogenase  55.48 
 
 		 451 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.241979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2044  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  53.57 
 
 		 456 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4200  glutamate dehydrogenase  53.14 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0109  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  54.29 
 
 		 453 aa  463  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0452  glutamate dehydrogenase  51.53 
 
 		 447 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5140  glutamate dehydrogenase  51.47 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04440  glutamate dehydrogenase  58.49 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1881  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  52.67 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.53168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1845  glutamate dehydrogenase  52.67 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0654574  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1459  glutamate dehydrogenase  52.37 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1871  glutamate dehydrogenase  52.67 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.598381  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1286  glutamate dehydrogenase  52.67 
 
 		 447 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000501948  hitchhiker  0.000436028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2481  glutamate dehydrogenase  52.22 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.231621  normal  0.944687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>