75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2030 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2030  protein of unknown function DUF134  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1343  protein of unknown function DUF134  48.75 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1427  protein of unknown function DUF134  40.35 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0886  hypothetical protein  39 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.799321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18270  predicted DNA-binding protein  46.07 
 
 
135 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2819  hypothetical protein  44.94 
 
 
156 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1249  protein of unknown function DUF134  39.52 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.928642  normal  0.573446 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1003  hypothetical protein  39.5 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2090  DNA-binding proteins-like protein  44.44 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000200078  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1487  protein of unknown function DUF134  35.34 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0241794  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000685  HTH DNA-binding protein  43.68 
 
 
96 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0090  hypothetical protein  48.24 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1147  hypothetical protein  52.5 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0587  hypothetical protein  41.38 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0135  hypothetical protein  47.06 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0906  hypothetical protein  38.89 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1340  hypothetical protein  44.71 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_195  DNA-binding protein  47.06 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0322712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1402  protein of unknown function DUF134  42.7 
 
 
143 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0218  DNA-binding protein, putative  47.06 
 
 
117 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.597835  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0197  protein of unknown function DUF134  31.36 
 
 
148 aa  62.4  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1428  hypothetical protein  41.38 
 
 
93 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814064  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1391  hypothetical protein  41.38 
 
 
93 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0627  protein of unknown function DUF134  35.04 
 
 
127 aa  62  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3434  protein of unknown function DUF134  41.38 
 
 
94 aa  62  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1655  hypothetical protein  42.7 
 
 
149 aa  61.6  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00120133  hitchhiker  0.00648564 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0933  protein of unknown function DUF134  40.26 
 
 
103 aa  61.6  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2435  hypothetical protein  46.34 
 
 
125 aa  61.6  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2279  protein of unknown function DUF134  38.38 
 
 
192 aa  61.6  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1146  protein of unknown function DUF134  37.72 
 
 
191 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143872  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2281  protein of unknown function DUF134  43.37 
 
 
140 aa  61.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.479687  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0753  hypothetical protein  39.33 
 
 
91 aa  61.2  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1642  hypothetical protein  35.88 
 
 
130 aa  61.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.176572  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0272  hypothetical protein  35.88 
 
 
130 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.185869  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0986  hypothetical protein  35.88 
 
 
130 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0214647  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1128  hypothetical protein  45.12 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0635  hypothetical protein  39.77 
 
 
112 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1492  hypothetical protein  39.33 
 
 
130 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1458  hypothetical protein  42.17 
 
 
228 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.53934  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0556  hypothetical protein  48.61 
 
 
127 aa  58.2  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.186851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3018  hypothetical protein  48.68 
 
 
132 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000905593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0233  protein of unknown function DUF134  38.6 
 
 
154 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1957  hypothetical protein  35.96 
 
 
138 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3913  hypothetical protein  39.56 
 
 
96 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0727  hypothetical protein  40.22 
 
 
98 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0342  hypothetical protein  44.78 
 
 
124 aa  56.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0144063  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0435  HTH DNA-binding protein  38.64 
 
 
168 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2142  hypothetical protein  39.77 
 
 
107 aa  54.7  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0501  hypothetical protein  41.86 
 
 
94 aa  54.7  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2345  protein of unknown function DUF134  44.44 
 
 
119 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0687  hypothetical protein  39.58 
 
 
98 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0263195  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0881  protein of unknown function DUF134  46.55 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.451175  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2278  protein of unknown function DUF134  40.7 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3699  hypothetical protein  39.13 
 
 
98 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2571  protein of unknown function DUF134  28.04 
 
 
231 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2417  protein of unknown function DUF134  34.07 
 
 
115 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0656  hypothetical protein  38.04 
 
 
98 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2217  hypothetical protein  38.2 
 
 
128 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2005  hypothetical protein  54 
 
 
114 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.456089  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1410  hypothetical protein  48.44 
 
 
118 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2161  HTH DNA-binding protein  32.73 
 
 
119 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  42.35 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1974  putative DNA-binding protein  45.9 
 
 
72 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0686  hypothetical protein  38.04 
 
 
98 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3639  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1763  hypothetical protein  50.94 
 
 
116 aa  49.7  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1194  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  48.9  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0048  hypothetical protein  41.57 
 
 
98 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0204  protein of unknown function DUF134  37.31 
 
 
95 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1046  hypothetical protein  39.73 
 
 
110 aa  46.6  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442649  normal  0.956961 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0730  hypothetical protein  49.09 
 
 
124 aa  45.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.736425  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1150  hypothetical protein  35.21 
 
 
201 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2602  protein of unknown function DUF134  42.19 
 
 
103 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000947411  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0830  hypothetical protein  43.33 
 
 
187 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125088  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1986  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.21 
 
 
119 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>