176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1446 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1446  NapC/NirT cytochrome c domain protein  100 
 
 
206 aa  429  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.148629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2086  NapC/NirT cytochrome c domain protein  58.1 
 
 
210 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1831  NapC/NirT cytochrome c family, N- region  52.28 
 
 
234 aa  224  9e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0799  putative tetraheme cytochrome c  43.24 
 
 
183 aa  149  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000122582  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0138  putative tetraheme cytochrome c  40.88 
 
 
190 aa  140  9e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0617458  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0435  putative tetraheme cytochrome c  39.47 
 
 
190 aa  132  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0127552  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1551  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  39.79 
 
 
190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  29.94 
 
 
180 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000671983  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0299  trimethylamine N-oxide reductase, cytochrome c-type subunit  28.48 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.649247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2384  NapC/NirT cytochrome c domain protein  27.78 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0340  cytochrome c-type protein nrfH  29.59 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.349319  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1547  cytochrome c-type protein nrfH  29.59 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1360  cytochrome c-type protein nrfH  29.59 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  25.73 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1504  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  30.81 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  30.73 
 
 
364 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06847  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  30.73 
 
 
364 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2867  cytochrome c nitrite reductase  28.75 
 
 
177 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  27.08 
 
 
378 aa  60.5  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  35.62 
 
 
390 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  35.62 
 
 
390 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  35.62 
 
 
390 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  35.62 
 
 
390 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  35.62 
 
 
390 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  35.62 
 
 
390 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  31.98 
 
 
366 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_002950  PG1821  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  25.45 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0195  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  30.9 
 
 
187 aa  58.2  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.14908 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  27.4 
 
 
368 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4051  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  34.25 
 
 
394 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  34.25 
 
 
394 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4034  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  34.25 
 
 
394 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4106  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  34.25 
 
 
394 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4155  cytochrome c-type protein torC  34.25 
 
 
394 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0295  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  31.65 
 
 
153 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000597678  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1338  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  28.82 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3540  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  30 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1043  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  31.21 
 
 
161 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00711927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3525  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  26.21 
 
 
392 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3983  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  29.38 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  27.06 
 
 
159 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1947  nitrate/TMAO reductase  28 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.674395  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00999  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c-type subunit  34.25 
 
 
390 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01006  hypothetical protein  34.25 
 
 
390 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1672  cytochrome c-type protein  37.97 
 
 
389 aa  55.5  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1243  cytochrome c-type protein NrfH  27.22 
 
 
166 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  45.76 
 
 
386 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000448194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02129  nitrate reductase, cytochrome c-type, periplasmic  29.19 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268616  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1457  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  29.19 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0739  cytochrome c-type protein NapC  29.19 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2350  cytochrome c-type protein NapC  29.19 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02088  hypothetical protein  29.19 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.254061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3339  cytochrome c-type protein NapC  29.19 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2340  cytochrome c-type protein NapC  29.19 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2501  cytochrome c-type protein NapC  29.19 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01844  TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c-type subunit  30.46 
 
 
366 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01833  hypothetical protein  30.46 
 
 
366 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2598  cytochrome c-type protein NapC  29.73 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.374466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2495  cytochrome c-type protein NapC  29.73 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0954  periplasmic nitrate reductase c-type cytochrome, NapC/NirT  28.89 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.448088 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2481  cytochrome c-type protein NapC  29.73 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2439  cytochrome c-type protein NapC  29.73 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.568439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2390  cytochrome c-type protein NapC  29.73 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1448  cytochrome c-type protein NapC  29.19 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2617  NapC/NirT cytochrome c domain protein  26.06 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4756  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  28.32 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2105  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  29.89 
 
 
366 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2166  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  29.89 
 
 
366 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4607  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  30.46 
 
 
158 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1759  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  29.89 
 
 
366 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1968  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  29.89 
 
 
366 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1767  NapC/NirT cytochrome c domain protein  31.98 
 
 
366 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.936098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0895  NapC/NirT cytochrome c-like  26.95 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.356443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1979  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  31.47 
 
 
172 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2983  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  26.29 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000569664  normal  0.0718991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0216  tetraheme cytochrome c  30.64 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4765  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  30.11 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.719721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1313  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  31.4 
 
 
366 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563249 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0082  NapC/NirT cytochrome c family protein  27.71 
 
 
155 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2818  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0706  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  27.56 
 
 
177 aa  52  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000199981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3777  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.56 
 
 
187 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.9098  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3850  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.56 
 
 
187 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2415  cytochrome c-type protein NapC  29.9 
 
 
200 aa  51.2  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4591  tetraheme cytochrome c  28.85 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3513  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  26.32 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.654609  normal  0.0192355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2719  cytochrome c-type protein NapC  29.9 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0614  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  25.87 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000167911  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0802  NapC/NirT cytochrome c-like  26.4 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1085  NapC/NirT cytochrome c-like  26.4 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2659  NapC/NirT cytochrome c-like  26.4 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2551  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family protein  29.14 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.476596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2399  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  25.74 
 
 
153 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.524559  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3977  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  26.92 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0700  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  39.58 
 
 
153 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0286  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.22 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.911507  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1915  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  27.22 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000371882  normal  0.91066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2579  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  26.4 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123088  normal  0.367368 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2788  cytochrome c-type protein NapC  25.41 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1275  cytochrome c-type protein NapC  25.41 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1389  cytochrome c-type protein NapC  25.41 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.701394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>