More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1263 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1263  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 		 414 aa  862    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1022  MiaB-like tRNA modifying enzyme  59.71 
 
 		 415 aa  554  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1067  hypothetical protein  61.89 
 
 		 416 aa  536  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385247  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0085  hypothetical protein  60.44 
 
 		 412 aa  529  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000595597  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0856  hypothetical protein  58.39 
 
 		 413 aa  519  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1086  MiaB-like tRNA modifying enzyme  56.8 
 
 		 416 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1024  MiaB-like tRNA modifying enzyme  57.04 
 
 		 416 aa  512  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0783  MiaB-like tRNA modifying enzyme  57.04 
 
 		 416 aa  511  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0698  MiaB-like tRNA modifying enzyme  57.18 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1072  hypothetical protein  54.11 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.63 
 
 		 432 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  33.88 
 
 		 448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  33.88 
 
 		 448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.42 
 
 		 449 aa  226  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  34.45 
 
 		 448 aa  224  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  33.57 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  33.26 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  33.26 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  33.26 
 
 		 450 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  33.26 
 
 		 450 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  33.26 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  33.26 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  33.26 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  33.26 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  33.26 
 
 		 450 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.54 
 
 		 429 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.3 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.16 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  33.73 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  33.03 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.98 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  34.7 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  33.88 
 
 		 450 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  33.57 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.01 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.02 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  33.26 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  33.17 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.75 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.74 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  32.92 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.17 
 
 		 434 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  31.58 
 
 		 440 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.02 
 
 		 456 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.68 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.92 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.42 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.44 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.45 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.5 
 
 		 430 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0789  tRNA 2-methylthioadenosine synthase  32.35 
 
 		 411 aa  202  6e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.594901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.23 
 
 		 466 aa  202  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.17 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.99 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.33 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.76 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0396  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.13 
 
 		 420 aa  200  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.342498  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  30.82 
 
 		 454 aa  199  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  32.56 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  32.56 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.93 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0217  MiaB family tRNA modification protein  32.88 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.46 
 
 		 439 aa  196  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.24 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.79 
 
 		 431 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.88 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  32.11 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.46 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2594  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.73 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.56 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  32.25 
 
 		 438 aa  192  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.52 
 
 		 425 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0935  MiaB-like radical SAM protein  32.73 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2980  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.21 
 
 		 425 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.065406 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0180  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32 
 
 		 434 aa  190  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.61 
 
 		 442 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.19 
 
 		 442 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  32.59 
 
 		 440 aa  189  9e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.62 
 
 		 408 aa  189  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  37.4 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4070  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.16 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2852  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.73 
 
 		 444 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  29.25 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.82 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  30.9 
 
 		 437 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.89 
 
 		 427 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2721  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.32 
 
 		 410 aa  186  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  29.85 
 
 		 441 aa  186  9e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2775  2-methylthioadenine synthetase  33.14 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.254506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4197  hypothetical protein  30.65 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3390  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.21 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1560  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.25 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  30.57 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2948  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.73 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  hitchhiker  0.001764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  29.25 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2722  hypothetical protein  31.41 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0360  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.22 
 
 		 422 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.84 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2843  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.02 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0252  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.73 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>