13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0927 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0927  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  374  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1127  hypothetical protein  49.46 
 
 
186 aa  186  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0998722  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0008  cpp12  48.92 
 
 
186 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.503941  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0153  Cpp12  49.45 
 
 
187 aa  157  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000831104  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1361  Cpp12  41.62 
 
 
187 aa  137  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000387376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 
262 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  28.12 
 
 
262 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 
262 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 
263 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.91 
 
 
262 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  27.34 
 
 
262 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  29.69 
 
 
262 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 
262 aa  41.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>