31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0563 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0563  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  32.12 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  30.06 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  30.81 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  30.06 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  29.27 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  34.35 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  34.35 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  34.35 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  34.75 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  28.4 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  28.4 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  28.4 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  33.59 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  31.29 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  33.33 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  33.33 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  27.78 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  33.33 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  33.33 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  33.33 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  33.33 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  33.33 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  28.83 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  27.5 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  29.17 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1751  hypothetical protein  26.54 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000749705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  28.48 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  29.65 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  28.57 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>