More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0518 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0518  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 130 aa  259  6.999999999999999e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1522  ExbDTolR family transport protein  60.94 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1741  ExbDTolR family transport protein  57.14 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.490579  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0690  ExbDTolR family transport protein  54.69 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00894494  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0920  putative polysaccharide deacetylase  53.17 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0743675  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1400  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.23 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.377979  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0198  TonB system transport protein ExbD  48.8 
 
 		 128 aa  115  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00125254  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  46.77 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  46.77 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  45.97 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000384782  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  33.87 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.48 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  33.06 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  33.06 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.67 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  32.26 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  29.37 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  29.91 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.91 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  28.57 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  28.57 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.33 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  30.83 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  30.83 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.05 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  31.15 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.97 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  31.97 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.91 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  31.71 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  31.71 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  28.57 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  30 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.09 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  28.33 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.09 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.09 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.09 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  27.56 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  31.06 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.91 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  29.01 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  27.05 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  34.13 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6883  putative TolR protein  30.89 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604254  normal  0.0755944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  28.23 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  33.06 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  28.21 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  27.78 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  28.33 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  31.09 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.09 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.24 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  28.23 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  31.09 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6027  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  28.46 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.09 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  31.09 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  30.58 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  31.09 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.09 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  30 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  31.09 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3232  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.78 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  28.46 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  30.65 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  33.33 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2585  protein TolR  33.33 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  28.33 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.27 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  33.6 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0395  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.98 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30482  hitchhiker  0.000338676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>