More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3754 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3754  phosphate ABC transporter, permease protein  100 
 
 
465 aa  927    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3317  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  60.47 
 
 
464 aa  558  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1072  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  63.33 
 
 
459 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.335242  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3628  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  59.06 
 
 
462 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1232  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.85 
 
 
462 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.68269  normal  0.54486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.68 
 
 
459 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0599  phosphate ABC transporter permease  56.7 
 
 
465 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.070485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  57.27 
 
 
460 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2408  ABC phosphate transporter inner membrane protein, PstC-like protein  54.39 
 
 
468 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  67.94 
 
 
566 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414974  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0169  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.39 
 
 
493 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0179  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.19 
 
 
493 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4550  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.64 
 
 
480 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0825  phosphate ABC transporter permease  52.09 
 
 
458 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2277  phosphate ABC transporter permease  50.67 
 
 
460 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.14 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1534  phosphate transport system permease protein  47.18 
 
 
489 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.718662  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0493  phosphate ABC transporter permease protein  45.49 
 
 
495 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2290  phosphate ABC transporter permease  48.76 
 
 
483 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0770  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.1 
 
 
497 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0798935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.48 
 
 
494 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1920  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.34 
 
 
480 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.71778  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_004310  BR2139  phosphate ABC transporter, permease protein  42.6 
 
 
496 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2054  phosphate ABC transporter, permease protein  42.6 
 
 
496 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46 
 
 
481 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2603  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  46.2 
 
 
481 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1227  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  45.73 
 
 
486 aa  368  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.696312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1261  phosphate ABC transporter permease  47.34 
 
 
492 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4329  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.36 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0107359  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0500  phosphate ABC transporter permease  55.69 
 
 
414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0465  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.09 
 
 
410 aa  352  8e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.870192  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1477  phosphate ABC transporter permease  56.43 
 
 
418 aa  349  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0377  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  56.38 
 
 
413 aa  349  6e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.9 
 
 
414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1858  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.1 
 
 
418 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.14 
 
 
409 aa  317  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.392493  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0717  phosphate ABC transporter, permease protein PstC, putative  46.71 
 
 
304 aa  279  7e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0643  phosphate ABC transporter, permease protein PstC, putative  46.71 
 
 
304 aa  279  7e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1055  putative phosphate ABC transporter, permease protein PstC  46.38 
 
 
304 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0202  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  48.34 
 
 
302 aa  275  1.0000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211138  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0145  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.89 
 
 
374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00254182  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0800  phosphate ABC transporter, permease protein  46.38 
 
 
304 aa  273  6e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0982  phosphate ABC transporter, permease protein  50.18 
 
 
374 aa  267  2e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3636  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.18 
 
 
304 aa  262  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.301349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  46.45 
 
 
295 aa  260  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.14 
 
 
314 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.15 
 
 
307 aa  246  8e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.51 
 
 
307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1250  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.39 
 
 
306 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.125763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.21 
 
 
320 aa  243  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2443  phosphate ABC transporter permease  44.19 
 
 
310 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0588  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.44 
 
 
319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.175196 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.64 
 
 
310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1655  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.67 
 
 
311 aa  237  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.35 
 
 
308 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1478  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.35 
 
 
308 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0682584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4156  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.75 
 
 
319 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4581  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.37 
 
 
313 aa  229  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.68 
 
 
343 aa  229  9e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.93 
 
 
321 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0046  phosphate ABC transporter permease  44.26 
 
 
313 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.72 
 
 
308 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0204  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  43.84 
 
 
324 aa  228  2e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00435822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4173  phosphate ABC transporter permease  39.1 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4495  phosphate ABC transporter permease  39.1 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1052  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.44 
 
 
309 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.130457  hitchhiker  0.0000180725 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4124  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.96 
 
 
316 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1023  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.44 
 
 
309 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.39 
 
 
324 aa  226  9e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.482233  normal  0.348466 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0959  phosphate ABC transporter, permease protein  43.16 
 
 
308 aa  225  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 
316 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236226 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4011  phosphate ABC transporter, permease  39.1 
 
 
316 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4021  phosphate ABC transporter, permease  38.78 
 
 
316 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  39.87 
 
 
320 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0287  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.58 
 
 
315 aa  223  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0473771  normal  0.154696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4351  phosphate ABC transporter, permease protein  40.83 
 
 
316 aa  222  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4387  phosphate ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 
316 aa  222  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0849  phosphate ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
316 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68749  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3563  phosphate ABC transporter permease  40.85 
 
 
311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4404  phosphate ABC transporter, permease protein  40.83 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  40.2 
 
 
310 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
325 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.42 
 
 
315 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.86 
 
 
350 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.3 
 
 
316 aa  213  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0331  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.72 
 
 
315 aa  212  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113685  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.1 
 
 
291 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.79 
 
 
290 aa  204  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.1 
 
 
291 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43 
 
 
324 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1792  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.69 
 
 
310 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.13 
 
 
291 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2359  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.34 
 
 
358 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.34 
 
 
296 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 
296 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  37.5 
 
 
318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.27 
 
 
292 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  35.08 
 
 
298 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.53 
 
 
297 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  37.01 
 
 
297 aa  176  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>