135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0336 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0336  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  191  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3177  hypothetical protein  68.89 
 
 		 90 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.293941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68000  hypothetical protein  68.18 
 
 		 90 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0291982  normal  0.0102639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5885  hypothetical protein  68.18 
 
 		 90 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0319  hypothetical protein  68.18 
 
 		 90 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0490853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4260  hypothetical protein  70.45 
 
 		 90 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221746  hitchhiker  0.00000000242965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04520  hypothetical protein  67.05 
 
 		 90 aa  133  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.683421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0285  hypothetical protein  67.05 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0305  hypothetical protein  67.05 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0310  hypothetical protein  67.05 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5343  hypothetical protein  66.67 
 
 		 90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4902  hypothetical protein  66.67 
 
 		 90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4923  hypothetical protein  65.91 
 
 		 90 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000436986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0523  hypothetical protein  58.89 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000507577  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0381  hypothetical protein  58.14 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3583  hypothetical protein  57.95 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.507536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0759  hypothetical protein  57.3 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1490  hypothetical protein  57.95 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0380307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1524  hypothetical protein  57.3 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.384209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1114  hypothetical protein  57.95 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158096  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1235  hypothetical protein  56.82 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1752  hypothetical protein  55.68 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2778  hypothetical protein  55.68 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1511  hypothetical protein  56.82 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2261  hypothetical protein  55.68 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3058  hypothetical protein  55.68 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2644  hypothetical protein  55.68 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2700  hypothetical protein  55.68 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0938348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1533  hypothetical protein  55.68 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.795875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2624  hypothetical protein  56.82 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.804415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2102  hypothetical protein  55.68 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.183711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2071  hypothetical protein  56.82 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.926717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5466  hypothetical protein  55.68 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1836  hypothetical protein  55.68 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703285  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5920  hypothetical protein  55.68 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2157  hypothetical protein  55.68 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2175  hypothetical protein  55.68 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2067  hypothetical protein  55.06 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2229  hypothetical protein  54.55 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1222  hypothetical protein  55.06 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2982  hypothetical protein  55.68 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2067  hypothetical protein  54.55 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2485  Fe(II) trafficking protein YggX  54.55 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0570791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1077  hypothetical protein  53.41 
 
 		 91 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2423  hypothetical protein  53.41 
 
 		 93 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1169  hypothetical protein  53.41 
 
 		 91 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0980986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2194  hypothetical protein  53.41 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.609831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1798  hypothetical protein  51.69 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.716542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1372  hypothetical protein  52.27 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1924  hypothetical protein  51.69 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2944  hypothetical protein  53.33 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0024  hypothetical protein  53.85 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.828588  normal  0.104747 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2572  hypothetical protein  53.41 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2959  hypothetical protein  53.41 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2268  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0094  hypothetical protein  51.76 
 
 		 96 aa  100  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0087  hypothetical protein  50.59 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0121  hypothetical protein  57.69 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000208752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2344  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3047  hypothetical protein  56.82 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45877  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0133  hypothetical protein  51.14 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1891  hypothetical protein  52.94 
 
 		 89 aa  95.9  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0856  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  95.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00283  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4642  hypothetical protein  54.55 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451223  hitchhiker  0.0000118597 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1902  hypothetical protein  51.76 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1218  hypothetical protein  55.56 
 
 		 92 aa  94.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000284712  normal  0.540197 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2699  hypothetical protein  53.41 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000360658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0075  hypothetical protein  54.44 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.206235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1107  hypothetical protein  54.44 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1318  hypothetical protein  54.44 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.959327  normal  0.498401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1179  hypothetical protein  53.33 
 
 		 92 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1250  hypothetical protein  53.33 
 
 		 92 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00387926  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1180  hypothetical protein  53.33 
 
 		 92 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000191738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3040  hypothetical protein  52.22 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000474974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1122  hypothetical protein  51.11 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000145882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2701  hypothetical protein  52.22 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3054  hypothetical protein  52.22 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00037558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1324  hypothetical protein  52.22 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000513126  normal  0.0116062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3197  hypothetical protein  52.22 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000564871  normal  0.56493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3369  hypothetical protein  52.22 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1263  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.339369  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0687  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.166712  normal  0.641044 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1668  hypothetical protein  51.14 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2491  hypothetical protein  51.69 
 
 		 91 aa  90.1  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4149  hypothetical protein  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.786111  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2874  hypothetical protein  48.86 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429816  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1850  Fe(II) trafficking protein YggX  51.72 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.302914  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0002  hypothetical protein  48.89 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000338126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03592  hypothetical protein  52.27 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002445  hypothetical protein  51.14 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000631832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01429  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2696  hypothetical protein  50.65 
 
 		 88 aa  86.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62763 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1132  hypothetical protein  42.53 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1142  hypothetical protein  50.65 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0818  hypothetical protein  45.56 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1002  hypothetical protein  42.53 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0880728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0152  hypothetical protein  45.56 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.957602  hitchhiker  0.0000034562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0819  hypothetical protein  45.56 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1057  hypothetical protein  42.7 
 
 		 105 aa  84.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.977359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>