16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0029 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0029  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 256 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  34.18 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  34.18 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  29.1 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  27.1 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  27.5 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  25.7 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  25.7 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  25.7 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  25.68 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  28.49 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  26.21 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  29.27 
 
 		 236 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  23.93 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  27.59 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  27.72 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>