30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2128 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2128  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  197  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70369  normal  0.722848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0837  hypothetical protein  74.19 
 
 
101 aa  150  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.05984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2465  hypothetical protein  72.34 
 
 
100 aa  147  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.705928  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2196  hypothetical protein  68.42 
 
 
96 aa  147  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.250793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3831  hypothetical protein  68.09 
 
 
96 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2049  hypothetical protein  66.32 
 
 
95 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2143  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00966347  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0747  hypothetical protein  66.67 
 
 
99 aa  137  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000864185  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0644  hypothetical protein  66.67 
 
 
99 aa  137  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0602249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34640  hypothetical protein  63.16 
 
 
98 aa  136  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1935  hypothetical protein  61.05 
 
 
96 aa  133  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.157401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0420  hypothetical protein  61.8 
 
 
100 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.3293  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2247  hypothetical protein  59.34 
 
 
133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2347  hypothetical protein  58.06 
 
 
103 aa  116  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.307924  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1981  hypothetical protein  58.06 
 
 
103 aa  116  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.11308  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4283  hypothetical protein  57.14 
 
 
170 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3836  hypothetical protein  55.43 
 
 
131 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.242387  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0484  hypothetical protein  56.99 
 
 
93 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0973  hypothetical protein  57.14 
 
 
140 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0086355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0141  hypothetical protein  59.77 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0143  hypothetical protein  59.77 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4140  hypothetical protein  54.95 
 
 
119 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4293  hypothetical protein  53.26 
 
 
119 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4271  hypothetical protein  52.17 
 
 
119 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0347  hypothetical protein  53.68 
 
 
100 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0003  hypothetical protein  54.02 
 
 
120 aa  100  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000143416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1968  hypothetical protein  53.41 
 
 
118 aa  100  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.426641  normal  0.147802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1762  hypothetical protein  48.86 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0762473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15960  hypothetical protein  46.91 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7257  hypothetical protein  35.71 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338582  normal  0.560667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>