63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1397 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2784    100 
 
 
2520 bp  2415    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.997058  normal  0.532998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0991    100 
 
 
6392 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.879827  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0992    100 
 
 
2348 bp  1800    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0215553  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1229    100 
 
 
903 bp  1790    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.00000000126373 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1270    100 
 
 
3351 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096474 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1299    100 
 
 
2847 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279672  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1397    100 
 
 
2376 bp  4710    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1398  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2329  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102713  hitchhiker  0.000965394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2608    100 
 
 
2160 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473471 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2609  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.720943  hitchhiker  0.00290124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2785  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.738177  normal  0.743727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3014  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3220  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3256  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0156341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3394  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.750621  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3592  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3606  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3863    97.3 
 
 
1109 bp  1955    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 
1110 bp  2192    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4087  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4106  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4171    100 
 
 
2922 bp  2416    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4172  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4396  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  normal  0.0139807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0643  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2966  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  99.23 
 
 
1149 bp  2000    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 
1110 bp  2192    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 
1110 bp  2192    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0564  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.561014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 
1110 bp  2192    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 
1110 bp  2192    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0446    97.3 
 
 
1109 bp  1955    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0471    97.3 
 
 
1109 bp  1955    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0589  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0593  transposase IS4 family protein  97.34 
 
 
864 bp  1530    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 
1110 bp  2192    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0098  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0100    100 
 
 
1935 bp  2415    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0101  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0170  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0595  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0600    97.3 
 
 
1109 bp  1955    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 
1110 bp  2192    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0630  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0594  hypothetical protein  96.85 
 
 
348 bp  597  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.761756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1230    100 
 
 
216 bp  428  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000843272 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1287  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  90.16 
 
 
1146 bp  73.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0654  putative DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  80.67 
 
 
1158 bp  67.9  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0377757  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1519  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  95 
 
 
1158 bp  63.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726824  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2628  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  100 
 
 
1149 bp  58  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3270  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
1146 bp  52  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0895  perosamine synthetase  92.11 
 
 
1155 bp  52  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1120  polysaccharide biosynthesis protein  92.11 
 
 
1149 bp  52  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1303  polysaccharide biosynthesis protein  96.55 
 
 
1143 bp  50.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.288123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>