78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4695 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4695  conjugal transfer protein TrbF  100 
 
 		 232 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6506  conjugal transfer protein TrbF  34.88 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4270  conjugal transfer protein TrbF  34.88 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117817  normal  0.0324718 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6631  conjugal transfer protein TrbF  34.88 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1665  Conjugal transfer protein  32.08 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0051  conjugal transfer protein TrbF  32.09 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4562  conjugal transfer protein TrbF  28.91 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5383  conjugal transfer protein TrbF  28.44 
 
 		 220 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2229  conjugal transfer protein TrbF  31.08 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373405  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5489  conjugal transfer protein TrbF  27.49 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9651  conjugal transfer protein TrbF  29.25 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2509  conjugal transfer protein  32.09 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal  0.64897 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8326  conjugal transfer protein TrbF  26.54 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2345  Conjugal transfer protein  30.84 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9260  conjugal transfer protein TrbF  25.12 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399754  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2353  Conjugal transfer protein  27.06 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.744768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1713  Conjugal transfer protein  25.64 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000549304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2011  conjugal transfer protein TrbF  30.95 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1289  conjugal transfer protein TrbF  30.48 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0431  conjugal transfer protein TrbF  29.52 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2357  conjugal transfer protein TrbF  30 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.109686  normal  0.258524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35650  conjugal transfer protein TrbF  29.52 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109489  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1557  conjugal transfer protein TrbF  29.67 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000776204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3499  conjugal transfer protein TrbF  29.33 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2577  conjugal transfer protein TrbF  29.05 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.756433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4201  conjugal transfer protein TrbF  26.92 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.902696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2904  conjugal transfer protein TrbF  28.85 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.071912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2651  conjugal transfer protein TrbF  28.85 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0552472  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1323  conjugal transfer protein TrbF  30.14 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2692  conjugal transfer protein TrbF  28.37 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0792392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1902  conjugal transfer protein TrbF  29.52 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.617323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30870  conjugal transfer protein TrbF  29.86 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177985  unclonable  2.25295e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1348  conjugal transfer protein TrbF  29.67 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000109379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3699  conjugal transfer protein TrbF  29.67 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7447  conjugal transfer protein TrbF  25.58 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0733  conjugal transfer protein TrbF  28.44 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0311  conjugal transfer protein TrbF  25.23 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3698  conjugal transfer protein TrbF  25.46 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1506  conjugal transfer protein TrbF  24.17 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0960  conjugal transfer protein TrbF  25.23 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3371  conjugal transfer protein TrbF  23.67 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1006  conjugal transfer protein TrbF  23.83 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2831  conjugal transfer protein TrbF  24.3 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.571124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5369  conjugal transfer protein TrbF  26.89 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682768  normal  0.410714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0692  conjugal transfer protein TrbF  22.75 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2607  conjugal transfer protein TrbF  22.43 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1694  conjugal transfer protein  25.79 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194664  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1392  conjugal transfer protein  25.79 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2093  conjugal transfer protein TrbF  21.5 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0618543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1477  conjugal transfer protein TrbF  21.63 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0985827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1841  conjugal transfer protein TrbF  24.17 
 
 		 232 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.377716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1487  conjugal transfer protein TrbF  22.43 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1146  conjugal transfer protein TrbF  26.67 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3834  conjugal transfer protein TrbF  21.33 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5216  conjugal transfer protein TrbF  26.89 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3993  conjugal transfer protein TrbF  21.03 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0169499  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2997  conjugal transfer protein TrbF  20.56 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0602  conjugal transfer protein TrbF  20.56 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3548  conjugal transfer protein TrbF  20.85 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1187  conjugal transfer protein TrbF  20.85 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3858  conjugal transfer protein TrbF  20.38 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00683431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2274  conjugal transfer protein TrbF  23.5 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.736535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3894  conjugal transfer protein TrbF  21.03 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3219  conjugal transfer protein TrbF  20.19 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00389999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0502  conjugal transfer protein TrbF  22.75 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0478499  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2317  conjugal transfer protein TrbF  23.22 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.643073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2033  conjugal transfer protein TrbF  23.67 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3093  conjugal transfer protein TrbF  19.16 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7748  conjugal transfer protein TrbF  22.27 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520847  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2885  conjugal transfer protein TrbF  21.8 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0742  conjugal transfer protein TrbF  21.8 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0256  conjugal transfer protein  25.34 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3201  conjugal transfer protein TrbF  20.19 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2479  conjugal transfer protein TrbF  22.22 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.901597  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0149  conjugal transfer protein TrbF  22.12 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3534  conjugal transfer protein TrbF  19.71 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776312  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5235  Type IV secretory pathway component VirB8-like  26.2 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0168  conjugal transfer protein TrbF  21.96 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577326  normal  0.249503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>