53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4659 on replicon NC_009999
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009999  Sbal195_4659  integrase, catalytic region  100 
 
 
43 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.63226  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  97.44 
 
 
392 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  97.44 
 
 
392 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  97.44 
 
 
392 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  97.44 
 
 
270 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  97.44 
 
 
270 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  97.44 
 
 
270 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  97.44 
 
 
270 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  97.44 
 
 
270 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  97.44 
 
 
270 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  97.44 
 
 
270 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  97.44 
 
 
270 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  97.44 
 
 
270 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  97.44 
 
 
203 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  94.87 
 
 
270 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  94.87 
 
 
270 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  89.74 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  63.41 
 
 
289 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  63.16 
 
 
253 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  63.16 
 
 
290 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  63.16 
 
 
290 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  63.16 
 
 
290 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  63.16 
 
 
290 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  63.16 
 
 
290 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  66.67 
 
 
276 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  66.67 
 
 
276 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  57.89 
 
 
278 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 
244 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  61.11 
 
 
276 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  61.11 
 
 
276 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  61.11 
 
 
276 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  61.11 
 
 
276 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  52.63 
 
 
248 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  52.63 
 
 
248 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1886  IS3 family transposase  61.29 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250279 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  52.63 
 
 
248 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  62.86 
 
 
271 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  62.86 
 
 
271 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  52.63 
 
 
248 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  62.86 
 
 
271 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  53.85 
 
 
277 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  52.63 
 
 
248 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>