43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2192 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2192  LexA regulated protein  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000507798  unclonable  0.00000365361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2242  LexA regulated protein  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000327754  decreased coverage  0.0000000000334576 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4515  LexA regulated protein  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2229  LexA regulated protein  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000771947  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2142  LexA regulated protein  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548725  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2035  LexA regulated protein  96.67 
 
 		 90 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000986212  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1940  LexA regulated protein  96.67 
 
 		 90 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000297749  hitchhiker  0.00153004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2138  LexA regulated protein  96.67 
 
 		 90 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000822243  decreased coverage  0.00000610258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1878  LexA regulated protein  96.67 
 
 		 90 aa  174  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000094707  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2331  LexA regulated protein  95.56 
 
 		 90 aa  173  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1989  LexA regulated protein  92.13 
 
 		 90 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2271  LexA regulated protein  90.91 
 
 		 90 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000195646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1911  LexA regulated protein  87.64 
 
 		 90 aa  157  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2052  LexA regulated protein  88.64 
 
 		 90 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000697819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2336  LexA regulated protein  87.5 
 
 		 91 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000157855  hitchhiker  0.0000638777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1918  LexA regulated protein  87.5 
 
 		 90 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393466  unclonable  0.00000185851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1702  LexA regulated protein  85.39 
 
 		 90 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000748973  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0803  LexA regulated protein  65.91 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000741586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0742  LexA regulated protein  65.91 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000825535  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0852  LexA regulated protein  65.91 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000487307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0816  LexA regulated protein  65.91 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000303434  normal  0.244625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0755  LexA regulated protein  65.91 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000819206  normal  0.247968 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2952  CopG domain protein DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000490271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0707  LexA regulated protein  62.5 
 
 		 97 aa  116  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000300993  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0565  LexA regulated protein  62.5 
 
 		 97 aa  116  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.1188e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0780  LexA regulated protein  62.5 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00633  hypothetical protein  62.5 
 
 		 97 aa  116  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000247285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2971  LexA regulated protein  62.5 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000139285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0713  LexA regulated protein  62.5 
 
 		 97 aa  116  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000236338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0732  LexA regulated protein  62.5 
 
 		 97 aa  116  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.95489e-22  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00642  LexA regulated protein  62.5 
 
 		 97 aa  116  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000294576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1200  LexA regulated protein  62.22 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000088434  hitchhiker  0.000162968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1238  LexA regulated protein  62.5 
 
 		 95 aa  114  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000306733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2989  LexA regulated protein  62.5 
 
 		 95 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0164984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0320  LexA regulated protein  62.5 
 
 		 95 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000691974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2899  LexA regulated protein  62.5 
 
 		 95 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000183415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1209  LexA regulated protein  61.36 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000498844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2936  LexA regulated protein  61.36 
 
 		 93 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.963687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3122  LexA regulated protein  60.23 
 
 		 93 aa  110  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000118498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1577  LexA regulated protein  58.33 
 
 		 93 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0875  LexA regulated protein  53.41 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1120  LexA regulated protein  59.09 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2886  LexA regulated protein  46.25 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000126708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>