10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4961 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4961  SgrS RNA  100 
 
 		 226 bp  448  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3529  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 132 bp  262  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0077  SgrS RNA  98.47 
 
 		 226 bp  244  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0075  hypothetical protein  98.18 
 
 		 132 bp  202  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0093    100 
 
 		 73 bp  145  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0123  SgrS RNA  95 
 
 		 238 bp  63.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.980235  normal  0.0251014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0119  SgrS RNA  92.5 
 
 		 238 bp  56  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163644  normal  0.42599 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0118  SgrS RNA  92.5 
 
 		 238 bp  56  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.165987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0123  SgrS RNA  92.5 
 
 		 238 bp  56  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0116  SgrS RNA  92.5 
 
 		 238 bp  56  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>