More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4228 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4228  phosphatase yidA  100 
 
 		 109 aa  225  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  98.13 
 
 		 270 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  98.13 
 
 		 270 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  98.13 
 
 		 270 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  98.13 
 
 		 270 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  98.13 
 
 		 270 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  97.2 
 
 		 270 aa  217  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  97.2 
 
 		 270 aa  215  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  97.2 
 
 		 270 aa  215  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  93.46 
 
 		 270 aa  209  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  93.46 
 
 		 270 aa  210  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  93.46 
 
 		 281 aa  209  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  93.46 
 
 		 281 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  92.52 
 
 		 281 aa  207  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  91.59 
 
 		 270 aa  183  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  68.27 
 
 		 269 aa  148  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  68.27 
 
 		 269 aa  148  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  68.27 
 
 		 269 aa  148  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  62.5 
 
 		 271 aa  142  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  65.38 
 
 		 279 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  65.38 
 
 		 271 aa  140  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  62.14 
 
 		 272 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  65.38 
 
 		 271 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  50 
 
 		 277 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  48.08 
 
 		 269 aa  95.5  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  49.04 
 
 		 269 aa  95.1  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  45.63 
 
 		 270 aa  94  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  44.23 
 
 		 266 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  44.23 
 
 		 266 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  39.05 
 
 		 286 aa  89  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  42.57 
 
 		 273 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  43.14 
 
 		 281 aa  85.5  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  44 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  40.2 
 
 		 274 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  38.32 
 
 		 270 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  42.55 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1176  HAD superfamily hydrolase  48.04 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.534777  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1509  HAD superfamily hydrolase  37.62 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  44.55 
 
 		 270 aa  77  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  45.12 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  36.96 
 
 		 267 aa  73.6  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2000  HAD superfamily hydrolase  35.56 
 
 		 273 aa  73.6  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  36.96 
 
 		 272 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  39.22 
 
 		 273 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  39 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  45.45 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 271 aa  68.2  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  35 
 
 		 266 aa  67.4  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  39.33 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  42.17 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  40.66 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  38.32 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  38.32 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  38.32 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  38.32 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.32 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 269 aa  64.7  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  45.45 
 
 		 268 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  37.62 
 
 		 268 aa  63.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  38.61 
 
 		 273 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  39.56 
 
 		 279 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  38.61 
 
 		 273 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.61 
 
 		 273 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.61 
 
 		 273 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  41.57 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  40.96 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  41.56 
 
 		 269 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  40.66 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  44.59 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  44.93 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  45.33 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  42.67 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  31.73 
 
 		 275 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  41.56 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  37.38 
 
 		 273 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  42.67 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  42.67 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  42.67 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  42.67 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  42.67 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  37.21 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  42.67 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  40.28 
 
 		 268 aa  60.5  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  39.77 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  39.77 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  39.77 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  39.77 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  39.77 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  40.91 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  39.77 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  34.38 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  39.77 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  39.77 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  39.77 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  45.33 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0231  Cof-like hydrolase  32.69 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  38.96 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  38.14 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  31.52 
 
 		 274 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  30.69 
 
 		 265 aa  57  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>