9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3962 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3962  yiaA/B two helix domain family protein  100 
 
 		 75 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4059  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  142  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4939  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.13194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03415  conserved inner membrane protein  98.57 
 
 		 113 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0147  YiaAB two helix domain protein  98.57 
 
 		 113 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3766  hypothetical protein  98.57 
 
 		 113 aa  141  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0151  hypothetical protein  98.57 
 
 		 113 aa  141  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03366  hypothetical protein  98.57 
 
 		 113 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3886  hypothetical protein  92.86 
 
 		 113 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>