117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3415 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02864  fused glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  99.84 
 
 		 619 aa  1286    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0708  Glutathionylspermidine amidase  100 
 
 		 619 aa  1289    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02813  hypothetical protein  99.84 
 
 		 619 aa  1286    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3393  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  82.52 
 
 		 620 aa  1073    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3168  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  99.84 
 
 		 619 aa  1286    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3455  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  100 
 
 		 619 aa  1289    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0705  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  100 
 
 		 619 aa  1289    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3274  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  99.84 
 
 		 619 aa  1287    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3415  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  100 
 
 		 619 aa  1289    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3392  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  90.13 
 
 		 618 aa  1165    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3386  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  90.13 
 
 		 618 aa  1167    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.696441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3321  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  90.13 
 
 		 618 aa  1167    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0646215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3312  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  90.13 
 
 		 618 aa  1167    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193053  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3486  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  89.97 
 
 		 618 aa  1165    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4300  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  99.84 
 
 		 619 aa  1287    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0216  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  48.08 
 
 		 625 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1235  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  47.63 
 
 		 629 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.114299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3723  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  48.24 
 
 		 642 aa  590  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4275  glutathionylspermidine synthase  28.84 
 
 		 386 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.747428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3450  glutathionylspermidine synthase  26.6 
 
 		 386 aa  138  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2359  glutathionylspermidine synthase  28.88 
 
 		 381 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01618  glutathionylspermidine synthase  26.63 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3621  glutathionylspermidine synthase  27.2 
 
 		 386 aa  135  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3446  glutathionylspermidine synthase  26.6 
 
 		 387 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3439  glutathionylspermidine synthase  26.6 
 
 		 387 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3374  glutathionylspermidine synthase  26.6 
 
 		 387 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3369  glutathionylspermidine synthase  26.6 
 
 		 387 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3541  glutathionylspermidine synthase  26.6 
 
 		 387 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02910  predicted enzyme  27.37 
 
 		 386 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0663  glutathionylspermidine synthase  27.37 
 
 		 386 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.553236  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02860  hypothetical protein  27.37 
 
 		 386 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3215  glutathionylspermidine synthase family protein  27.37 
 
 		 386 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3502  glutathionylspermidine synthase family protein  27.37 
 
 		 386 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000151418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0660  glutathionylspermidine synthase  27.37 
 
 		 386 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3332  glutathionylspermidine synthase family protein  27.37 
 
 		 386 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3470  glutathionylspermidine synthase family protein  27.37 
 
 		 386 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000295312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4351  glutathionylspermidine synthase family protein  27.37 
 
 		 386 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00967413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1405  glutathionylspermidine synthase  28.54 
 
 		 385 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0571  putative glutathionylspermidine synthase  28.8 
 
 		 386 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0651  glutathionylspermidine synthase  28.8 
 
 		 386 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5048  glutathionylspermidine synthase  27.69 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2484  glutathionylspermidine synthase  28.76 
 
 		 382 aa  127  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003906  glutathionylspermidine synthase  27.49 
 
 		 388 aa  127  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.763675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0287  hypothetical protein  28.53 
 
 		 386 aa  127  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1219  glutathionylspermidine synthase  26.89 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4430  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  27.81 
 
 		 387 aa  125  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4746  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  27.81 
 
 		 387 aa  125  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.260545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5702  glutathionylspermidine synthase domain protein  27.27 
 
 		 387 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.515802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0311  Trypanothione synthase  28 
 
 		 386 aa  124  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3807  glutathionylspermidine synthase  27.27 
 
 		 387 aa  124  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04053  predicted synthetase/amidase  27.01 
 
 		 387 aa  123  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3827  glutathionylspermidine synthase  27.01 
 
 		 387 aa  123  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000494371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5565  glutathionylspermidine synthase  26.34 
 
 		 384 aa  123  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3779  glutathionylspermidine synthase  26.69 
 
 		 386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.326667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0321  glutathionylspermidine synthase  27.47 
 
 		 386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1698  glutathionylspermidine synthase  26.79 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.231799  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4657  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  27.01 
 
 		 387 aa  122  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4644  glutathionylspermidine synthase domain protein  26.54 
 
 		 387 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4794  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  26.54 
 
 		 387 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4653  glutathionylspermidine synthase domain protein  26.54 
 
 		 387 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3915  glutathionylspermidine synthase  26.53 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4773  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  26.54 
 
 		 387 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4737  glutathionylspermidine synthase domain protein  26.27 
 
 		 387 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5551  glutathionylspermidine synthase  28.07 
 
 		 385 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3780  glutathionylspermidine synthase family protein  26.84 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01240  glutathionylspermidine synthase  28.33 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.636699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02190  synthetase/amidase  24.36 
 
 		 388 aa  114  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5279  glutathionylspermidine synthase  25.56 
 
 		 385 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5405  glutathionylspermidine synthase  25.39 
 
 		 384 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1247  glutathionylspermidine synthase  25.06 
 
 		 407 aa  112  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2241  glutathionylspermidine synthase  26.87 
 
 		 373 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1573  glutathionylspermidine synthase  27.2 
 
 		 401 aa  110  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0108547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4889  glutathionylspermidine synthase  27.47 
 
 		 377 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1876  glutathionylspermidine synthase  26.61 
 
 		 375 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4716  glutathionylspermidine synthase domain protein  26.58 
 
 		 352 aa  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0115  glutathionylspermidine synthase  28.17 
 
 		 387 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7051  glutathionylspermidine synthase  26.02 
 
 		 386 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5199  glutathionylspermidine synthase  27.91 
 
 		 387 aa  108  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4277  glutathionylspermidine synthase  24.55 
 
 		 386 aa  107  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.124865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6550  putative glutathionylspermidine synthase family protein  25.97 
 
 		 386 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4658  glutathionylspermidine synthase  27.48 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.46187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5121  glutathionylspermidine synthase  26.41 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5363  glutathionylspermidine synthetase  25.69 
 
 		 384 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01335  putative glutathionylspermidine synthase  25.71 
 
 		 385 aa  97.4  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.971977  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2757  glutathionylspermidine synthase  25 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8737  glutathionylspermidine synthase  25.38 
 
 		 393 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1553  glutathionylspermidine synthase family protein  24.86 
 
 		 390 aa  95.5  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0090  glutathionylspermidine synthase  28.13 
 
 		 393 aa  95.1  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346525  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1647  glutathionylspermidine synthase subfamily protein  26.71 
 
 		 393 aa  93.6  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3591  hypothetical protein  22.89 
 
 		 406 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.274003  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1541  glutathionylspermidine synthase family protein  25.07 
 
 		 392 aa  93.6  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0421  glutathionylspermidine synthase family protein  24.79 
 
 		 389 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0396  glutathionylspermidine synthase family protein  24.79 
 
 		 389 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.338468  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1585  glutathionylspermidine synthase family protein  23.93 
 
 		 389 aa  91.3  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3849  glutathionylspermidine synthase  23.08 
 
 		 392 aa  91.3  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3045  glutathionylspermidine synthase  24.93 
 
 		 391 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1471  glutathionylspermidine synthase  25 
 
 		 392 aa  89.7  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3071  glutathionylspermidine synthase  23.3 
 
 		 400 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.742359  normal  0.268432 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3426  hypothetical protein  23.3 
 
 		 400 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1327  glutathionylspermidine synthase  25.06 
 
 		 407 aa  88.6  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>