24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3069 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3069  L-fucose isomerase  100 
 
 		 65 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00585923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0886  L-fucose isomerase  98.31 
 
 		 591 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02614  hypothetical protein  98.31 
 
 		 586 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4066  L-fucose isomerase  98.31 
 
 		 591 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2946  L-fucose isomerase  98.31 
 
 		 591 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3107  L-fucose isomerase  98.31 
 
 		 591 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000142364  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0910  L-fucose isomerase  98.31 
 
 		 591 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2943  L-fucose isomerase  98.31 
 
 		 591 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301551  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02653  L-fucose isomerase  98.31 
 
 		 591 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3186  L-fucose isomerase  93.22 
 
 		 591 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3301  L-fucose isomerase  93.22 
 
 		 591 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3121  L-fucose isomerase  93.22 
 
 		 591 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3138  L-fucose isomerase  93.22 
 
 		 591 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3201  L-fucose isomerase  93.22 
 
 		 591 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1448  L-fucose isomerase  77.97 
 
 		 588 aa  101  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2073  L-fucose isomerase  71.93 
 
 		 604 aa  97.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3155  L-fucose isomerase  68.97 
 
 		 597 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1048  L-fucose isomerase  67.24 
 
 		 597 aa  93.6  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0870  L-fucose isomerase  67.8 
 
 		 590 aa  90.5  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1832  L-fucose isomerase  67.27 
 
 		 592 aa  89  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.275484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0410  L-fucose isomerase  66.67 
 
 		 606 aa  89  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.308786  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2489  L-fucose isomerase  65.45 
 
 		 593 aa  86.3  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3213  L-fucose isomerase  65.45 
 
 		 596 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09570  L-fucose isomerase  61.67 
 
 		 603 aa  84  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>